RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498575.1

PRRT1-212, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRRT1, Length 548 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-212ENST00000498575 DPH3Q96FX2 82 aa7.08□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 A0A1W2PNN7 141 aa7.07□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 DPM2O94777 84 aa7.07□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 PLNP26678 52 aa7.07□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 LINC01545Q5VT33 79 aa7.07□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 MUC2Q02817 5179 aa7.07□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 IGKCP01834 107 aa7.06□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 C3orf79P0CE67 100 aa7.06□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 PET117Q6UWS5 81 aa7.06□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.06□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 KRTAP10-8P60410 259 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 GAGE2EQ4V326 116 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 SFTA2Q6UW10 78 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.05□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 COX17Q14061 63 aa7.03□□□□□ -1.28
PRRT1-212ENST00000498575 FAM168BA1KXE4 195 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 LEPROTO15243 131 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 C5orf52A6NGY3 159 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 KRTDAPP60985 99 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 ERG28Q9UKR5 140 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 E9PLD3 99 aa7□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 J3QQQ9 107 aa7□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 S100A6P06703 90 aa7□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 HERVK_113P61574 105 aa7□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 C7orf33Q8WU49 177 aa7□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 XAGE1AQ9HD64 81 aa7□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 NDUFA12Q9UI09 145 aa7□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 PFN2P35080 140 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 HERV-K104P63124 156 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 S100A2P29034 98 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 NMUP48645 174 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 C22orf24Q9Y442 160 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRT1-212ENST00000498575 C20orf202A1L168 122 aa6.96□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 LINC00587B1AMM8 73 aa6.96□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 M0QXV9 152 aa6.96□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 SMIM13P0DJ93 91 aa6.96□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 AKR1D1P51857 326 aa6.96□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.95□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 LINC00158P58513 81 aa6.95□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 REG3GQ6UW15 175 aa6.95□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.95□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.94□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 VPREB1P12018 145 aa6.94□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.94□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.94□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.94□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.94□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 A0A0J9YXY3 114 aa6.93□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.93□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 Q8NDZ9 215 aa6.93□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.93□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 A0A0U1RRA0 63 aa6.92□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 ATOH7Q8N100 152 aa6.92□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 LINC00167Q96N53 147 aa6.92□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 TIMM17BO60830 172 aa6.9□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 LITAFQ99732 161 aa6.9□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.9□□□□□ -1.3
PRRT1-212ENST00000498575 UBE2BP63146 152 aa6.89□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 C1orf137Q5JT78 98 aa6.89□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.89□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.89□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.89□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 ZNF815PA8K554 130 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 IGLV7-43P04211 117 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 DAND5Q8N907 189 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 PCP2Q8IVA1 136 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 GAGE10A6NGK3 116 aa6.86□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.86□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 M0R378 163 aa6.86□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 NDUFC2O95298 119 aa6.85□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 SCGB1D1O95968 90 aa6.85□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.84□□□□□ -1.31
PRRT1-212ENST00000498575 A0A0U1RQV1 116 aa6.84□□□□□ -1.31
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