RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498524.5

ANKRD28-213, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,289 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-213ENST00000498524 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.77□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 SERP2Q8N6R1 65 aa2.77□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 AKAP13Q12802 2813 aa2.77□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6ZTC4 211 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 SMIM1B2RUZ4 78 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 DEFB4AO15263 64 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6JHZ5 121 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 C11orf72Q8NBR9 251 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 MUC4Q99102 2169 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 CR1P17927 2039 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 RPL28P46779 137 aaKnown RBP2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 C5orf38Q86SI9 138 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 REV3LO60673 3130 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 WDFY4Q6ZS81 3184 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 VPS13AQ96RL7 3174 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 M0R378 163 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 PRM2P04554 102 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 HAMPP81172 84 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 LITAFQ99732 161 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 MGAQ8IWI9 3026 aa2.76□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 NBEAQ8NFP9 2946 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 XCL1P47992 114 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC01600Q96MT4 127 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 H3BQ85 93 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 KIAA0087Q14695 138 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 TEX15Q9BXT5 2789 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 Q6ZTI0 123 aa2.75□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 ODF3L2Q3SX64 289 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 NCR3O14931 201 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 PDE6GP18545 87 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 COX6A2Q02221 97 aa2.74□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 APLNQ9ULZ1 77 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 ITPR2Q14571 2701 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 C20orf197Q8N268 126 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 UPK3BQ9BT76 320 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00313P59037 77 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 CLPSL2Q6UWE3 100 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 ANGP03950 147 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 SLPIP03973 132 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.73□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 FBN3Q75N90 2809 aa2.72□□□□□ -1.97
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ANKRD28-213ENST00000498524 F8WEM9 126 aa2.72□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 ENHOQ6UWT2 76 aa2.72□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.72□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A087WYN8 130 aa2.72□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC01554Q52M75 96 aa2.72□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 LELP1Q5T871 98 aa2.72□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00337Q8N6G1 96 aa2.72□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 SPEGQ15772 3267 aa2.72□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 FRYLO94915 3013 aa2.72□□□□□ -1.97
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ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00846Q9NV44 126 aa2.71□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 CELA1Q9UNI1 258 aa2.71□□□□□ -1.97
ANKRD28-213ENST00000498524 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 Q8IZM0 81 aa2.71□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.71□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa2.71□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 COX17Q14061 63 aa2.71□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 SMCR5Q8TEV8 140 aa2.71□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 DIRC1Q969H9 104 aa2.71□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 ITPR1Q14643 2758 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 A0A096LPF7 62 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 NDUFC1O43677 76 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 SPAG11BQ08648 103 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 Q8N814 137 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 Q8N1X5 172 aa2.7□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 A8MTW9 85 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 FLNCQ14315 2725 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 K7ERS5 55 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 Q8NAQ8 132 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.69□□□□□ -1.98
ANKRD28-213ENST00000498524 BSNQ9UPA5 3926 aa2.69□□□□□ -1.98
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