RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495217.1

PRDM15-215, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM15, Length 703 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-215ENST00000495217 HIST1H2BDP58876 126 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-215ENST00000495217 HIST1H2BCP62807 126 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-215ENST00000495217 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-215ENST00000495217 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-215ENST00000495217 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.48□□□□□ -1.21
PRDM15-215ENST00000495217 C12orf57Q99622 126 aa7.48□□□□□ -1.21
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PRDM15-215ENST00000495217 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.48□□□□□ -1.21
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PRDM15-215ENST00000495217 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.29□□□□□ -1.24
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PRDM15-215ENST00000495217 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.28□□□□□ -1.24
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PRDM15-215ENST00000495217 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 KRTDAPP60985 99 aa7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 VAMP8Q9BV40 100 aa7.25□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 MOBPQ13875 183 aa7.24□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.24□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 Q8N377 158 aa7.24□□□□□ -1.25
PRDM15-215ENST00000495217 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.23□□□□□ -1.25
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