RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 LEPROTL1O95214 131 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00310P59036 64 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 Q8NDZ9 215 aa9.96□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.95□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 COLCA2A8K830 154 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 ATP6V1G1O75348 118 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.93□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM238C9JI98 176 aa9.92□□□□□ -0.82
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SH3BP4-211ENST00000493436 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM126AQ9H061 195 aa9.92□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A087X002 238 aa9.91□□□□□ -0.82
SH3BP4-211ENST00000493436 CRYGAP11844 174 aa9.91□□□□□ -0.82
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SH3BP4-211ENST00000493436 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.91□□□□□ -0.82
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SH3BP4-211ENST00000493436 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.88□□□□□ -0.83
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SH3BP4-211ENST00000493436 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 DPM2O94777 84 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa9.86□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 TSPAN13O95857 204 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKCP01834 107 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 HERVK_113P61574 105 aa9.85□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 NCR3O14931 201 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP4-211ENST00000493436 J3QQQ9 107 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-211ENST00000493436 PRR4Q16378 134 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP4-211ENST00000493436 HIGD2AQ9BW72 106 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-211ENST00000493436 PRYO14603 147 aa9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-211ENST00000493436 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.81□□□□□ -0.84
SH3BP4-211ENST00000493436 NMUP48645 174 aa9.81□□□□□ -0.84
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SH3BP4-211ENST00000493436 HIST1H2BKO60814 126 aa9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-211ENST00000493436 HIST1H2BJP06899 126 aa9.8□□□□□ -0.84
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SH3BP4-211ENST00000493436 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.8□□□□□ -0.84
SH3BP4-211ENST00000493436 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.8□□□□□ -0.84
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SH3BP4-211ENST00000493436 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.79□□□□□ -0.84
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SH3BP4-211ENST00000493436 RNF213Q63HN8 5207 aa9.78□□□□□ -0.84
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SH3BP4-211ENST00000493436 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
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SH3BP4-211ENST00000493436 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
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SH3BP4-211ENST00000493436 LINC01545Q5VT33 79 aa9.71□□□□□ -0.86
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SH3BP4-211ENST00000493436 B5MCH6 92 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 S100A7L2Q5SY68 101 aa9.69□□□□□ -0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.69□□□□□ -0.86
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SH3BP4-211ENST00000493436 IGLV6-57P01721 117 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 C3orf79P0CE67 100 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 CTAG1AP78358 180 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.66□□□□□ -0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTDAPP60985 99 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 LITAFQ99732 161 aa9.65□□□□□ -0.86
SH3BP4-211ENST00000493436 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ZNF815PA8K554 130 aa9.64□□□□□ -0.87
SH3BP4-211ENST00000493436 ERC2-IT1O76042 136 aa9.64□□□□□ -0.87
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