RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492698.1

LAMA5-211, Transcript of laminin subunit alpha 5, humanhuman

TSL 3

Gene LAMA5, Length 894 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA5-211ENST00000492698 PRSS2P07478 247 aa8.28□□□□□ -1.08
LAMA5-211ENST00000492698 HERV-K104P63124 156 aa8.28□□□□□ -1.08
LAMA5-211ENST00000492698 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.28□□□□□ -1.08
LAMA5-211ENST00000492698 CFAP161Q6P656 301 aa8.28□□□□□ -1.08
LAMA5-211ENST00000492698 LITAFQ99732 161 aa8.28□□□□□ -1.08
LAMA5-211ENST00000492698 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.28□□□□□ -1.08
LAMA5-211ENST00000492698 MT1HL1P0DM35 61 aa8.27□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 SPAG11BQ08648 103 aa8.27□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 HSD52Q0P140 79 aa8.27□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 TIMM17BO60830 172 aa8.26□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 TAL2Q16559 108 aa8.26□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 SFTA2Q6UW10 78 aa8.26□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 C2orf82Q6UX34 121 aa8.26□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 CXCL5P42830 114 aa8.25□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa8.25□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.25□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 CKS1BP61024 79 aa8.24□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.24□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.24□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 HIST1H4GQ99525 98 aa8.24□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 TMEM238C9JI98 176 aa8.23□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 M0R143 59 aa8.23□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.23□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 CEND1Q8N111 149 aa8.23□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.23□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 SPANXCQ9NY87 97 aa8.23□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 SMIM13P0DJ93 91 aa8.22□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 C10orf25Q5T742 122 aa8.22□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 C2orf48Q96LS8 159 aa8.22□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 CARD19Q96LW7 228 aa8.22□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.22□□□□□ -1.09
LAMA5-211ENST00000492698 F8WDY8 70 aa8.21□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.21□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.21□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 Q6ZVH6 145 aa8.21□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 ERG28Q9UKR5 140 aa8.21□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 FXYD2P54710 66 aa8.2□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 PRR3P79522 188 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 SYCNQ0VAF6 134 aa8.2□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa8.2□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 Q6ZRU5 148 aa8.2□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.2□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 A0A0U1RRA0 63 aa8.19□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 PTTG1IPP53801 180 aa8.19□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 BATFQ16520 125 aa8.19□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 DAND5Q8N907 189 aa8.19□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 C7orf33Q8WU49 177 aa8.19□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 IFITM1P13164 125 aa8.18□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 PFN2P35080 140 aa8.18□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 LINC00158P58513 81 aa8.18□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 COX17Q14061 63 aa8.18□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.18□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.18□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.18□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.17□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.17□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.17□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.17□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 A0A1W2PNN7 141 aa8.16□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 GAGE2BQ13066 116 aa8.16□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.16□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 NPC2P61916 151 aa8.15□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 RNF151Q2KHN1 245 aa8.15□□□□□ -1.1
LAMA5-211ENST00000492698 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.14□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 A0A1B0GWB2 263 aa8.14□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 A4D1N5 150 aa8.14□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 A6NDN8 102 aa8.14□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.14□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 ARL17AQ8IVW1 177 aa8.14□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.13□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.13□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 A6NJY4 79 aa8.13□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 CFC1BP0CG36 223 aa8.13□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 CFC1P0CG37 223 aa8.13□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 COPS9Q8WXC6 57 aa8.13□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 TNXBP22105 4242 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.12□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 K7ERJ3 54 aa8.11□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 TAX1BP3O14907 124 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 LINC01600Q96MT4 127 aa8.1□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 A0A0B4J2C4 111 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 PKIGQ9Y2B9 76 aa8.09□□□□□ -1.11
LAMA5-211ENST00000492698 FAM168BA1KXE4 195 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA5-211ENST00000492698 Q6ZRP5 223 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA5-211ENST00000492698 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.08□□□□□ -1.12
LAMA5-211ENST00000492698 SPINK6Q6UWN8 80 aa8.07□□□□□ -1.12
LAMA5-211ENST00000492698 Q8NDZ9 215 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms