RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491833.5

SSR4-212, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, humanhuman

TSL 3

Gene SSR4, Length 921 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4-212ENST00000491833 C3orf79P0CE67 100 aa8.67□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 AKR1D1P51857 326 aa8.67□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 SFTA2Q6UW10 78 aa8.67□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 TMEM223A0PJW6 202 aa8.66□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 KIAA0087Q14695 138 aa8.66□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.66□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.66□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.65□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 UBE2BP63146 152 aa8.65□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 LINC01545Q5VT33 79 aa8.65□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.65□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.65□□□□□ -1.02
SSR4-212ENST00000491833 M0QXV9 152 aa8.64□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.64□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 C10orf25Q5T742 122 aa8.64□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 GAGE2EQ4V326 116 aa8.62□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.62□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 C5orf52A6NGY3 159 aa8.61□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.61□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 LEPROTO15243 131 aa8.61□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.61□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.6□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.6□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.6□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 J3QQQ9 107 aa8.59□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 TSPAN13O95857 204 aa8.59□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 SCGB1D1O95968 90 aa8.59□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 PFN2P35080 140 aa8.59□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.59□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 ERG28Q9UKR5 140 aa8.59□□□□□ -1.03
SSR4-212ENST00000491833 NMUP48645 174 aa8.58□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 HERV-K104P63124 156 aa8.58□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 ATOH7Q8N100 152 aa8.58□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 LINC00587B1AMM8 73 aa8.57□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 E9PLD3 99 aa8.57□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 ZNF861PO60384 105 aa8.56□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 LINC00158P58513 81 aa8.56□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.55□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 COX17Q14061 63 aa8.55□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 A0A0U1RRA0 63 aa8.54□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.54□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 MUC17Q685J3 4493 aa8.54□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 ZNF815PA8K554 130 aa8.53□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SSR4-212ENST00000491833 SMIM13P0DJ93 91 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.52□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 A0A087X002 238 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.51□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.5□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 CRYGAP11844 174 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.49□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.48□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 A0A0J9YXY3 114 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 VAMP8Q9BV40 100 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 CDIP1Q9H305 208 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 C22orf24Q9Y442 160 aa8.47□□□□□ -1.05
SSR4-212ENST00000491833 TMEM238C9JI98 176 aa8.46□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 TPRXLQ17RH7 258 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 DAND5Q8N907 189 aa8.45□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 BCE1O60756 84 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 NPC2P61916 151 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.44□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 TIMM17BO60830 172 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 SPATA45Q537H7 98 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 PCP2Q8IVA1 136 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 COPS9Q8WXC6 57 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.43□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.42□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 GAGE10A6NGK3 116 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 S100A12P80511 92 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.41□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 NCR3O14931 201 aa8.4□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.4□□□□□ -1.06
SSR4-212ENST00000491833 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.39□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.39□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 VPREB1P12018 145 aa8.39□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.38□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.37□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 COX8AP10176 69 aa8.37□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 PYY3Q5JQD4 70 aa8.37□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.36□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 M0R378 163 aa8.36□□□□□ -1.07
SSR4-212ENST00000491833 IGKV2D-28P01615 120 aa8.36□□□□□ -1.07
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