RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	COX8A	P10176	69 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPAG11B	Q08648	103 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZRU5	148 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		3.95	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0J9YXY3	114 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		H3BRM9	83 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA1	O15239	70 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	NMU	P48645	174 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC01620	Q4KN68	170 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8IZM0	81 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8NDZ9	215 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		3.94	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	MYMX	A0A1B0GTQ4	84 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		3.93	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1B0GVY2	172 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF815P	A8K554	130 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	PANO1	I0J062	215 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	DLEU1	O43261	78 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	HERVK_113	P61574	105 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	DAND5	Q8N907	189 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	RMI2	Q96E14	147 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	C2orf48	Q96LS8	159 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		3.92	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	PKD1	P98161	4303 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGLV2-33	A0A075B6J2	118 aa	Predicted RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0U1RRA0	63 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMIM13	P0DJ93	91 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	SYCN	Q0VAF6	134 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q6ZRP5	223 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q8N814	137 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		3.91	□□□□□ -1.78
RABGGTB-212	ENST00000491266	PSCA	O43653	123 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	APOM	O95445	188 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	3.9	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	S100A12	P80511	92 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		3.9	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00587	B1AMM8	73 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	CHTF8	P0CG12	524 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	PFN2	P35080	140 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	XG	P55808	180 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	3.89	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIGD1B	Q9P298	99 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	ERG28	Q9UKR5	140 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A096LNI7	61 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	TIMM17B	O60830	172 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDT	P30046	118 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP10-1	P60331	282 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	CKS1B	P61024	79 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	NPC2	P61916	151 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	CTAG1A	P78358	180 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	CARD19	Q96LW7	228 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		3.88	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PNN7	141 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM168B	A1KXE4	195 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXCL5	P42830	114 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	FXYD2	P54710	66 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00158	P58513	81 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	HERV-K104	P63124	156 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	SPANXC	Q9NY87	97 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		3.87	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCP4L1	A6NKN8	68 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	EPM2A	B3EWF7	344 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266		F8WDY8	70 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	IGKV2D-28	P01615	120 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	3.86	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		3.86	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	3.85	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	C14orf177	Q52M58	125 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		3.85	□□□□□ -1.79
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		3.85	□□□□□ -1.79

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