RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	NMU	P48645	174 aa		10.68	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00158	P58513	81 aa		10.68	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		10.68	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		10.68	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424		J3QQQ9	107 aa		10.67	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	LBH	Q53QV2	105 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		10.67	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM168B	A1KXE4	195 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424		E9PLD3	99 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424		M0QXV9	152 aa		10.65	□□□□□ -0.7
HDAC10-216	ENST00000489424	SNRPE	P62304	92 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2B	P63146	152 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		10.64	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP10-8	P60410	259 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TNXB	P22105	4242 aa		10.63	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		10.62	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0U1RRA0	63 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM13	P0DJ93	91 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	C22orf24	Q9Y442	160 aa		10.61	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	C5orf52	A6NGY3	159 aa		10.59	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		10.59	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	10.59	□□□□□ -0.71
HDAC10-216	ENST00000489424	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		10.57	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	C1orf137	Q5JT78	98 aa		10.57	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		10.57	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	DIRC1	Q969H9	104 aa		10.57	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		10.56	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV7-43	P04211	117 aa		10.56	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		10.56	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		10.55	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	ATOH7	Q8N100	152 aa		10.55	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF815P	A8K554	130 aa		10.54	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGB1D1	O95968	90 aa		10.54	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00167	Q96N53	147 aa		10.53	□□□□□ -0.72
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0J9YXY3	114 aa		10.52	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	BOD1L2	Q8IYS8	172 aa		10.52	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE10	A6NGK3	116 aa		10.51	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424		H0Y9J4	135 aa		10.51	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	VPREB1	P12018	145 aa		10.51	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		10.51	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		10.5	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R378	163 aa		10.5	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMM17B	O60830	172 aa		10.5	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		10.5	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV2D-26	A0A0A0MRZ7	120 aa		10.49	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A12	P80511	92 aa		10.49	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	DAND5	Q8N907	189 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	COPS9	Q8WXC6	57 aa		10.48	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		10.47	□□□□□ -0.73
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM238	C9JI98	176 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV2D-28	P01615	120 aa		10.45	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF861P	O60384	105 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	BCE1	O60756	84 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFC2	O95298	119 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TTTY13	Q9BZ97	58 aa		10.44	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	NCR3	O14931	201 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		10.43	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2A	P49459	152 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	NPC2	P61916	151 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZVH6	145 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	CBY1	Q9Y3M2	126 aa		10.42	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	PCP2	Q8IVA1	136 aa		10.41	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8NDZ9	215 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	SPANXC	Q9NY87	97 aa		10.4	□□□□□ -0.74
HDAC10-216	ENST00000489424	IFITM1	P13164	125 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	LITAF	Q99732	161 aa		10.39	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	LRP2	P98164	4655 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	PRY	O14603	147 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	JOSD1	Q15040	202 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00518	Q8N0U6	118 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM126A	Q9H061	195 aa		10.38	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	DDT	P30046	118 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	VAMP8	Q9BV40	100 aa		10.37	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		10.36	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		10.35	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		10.35	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		10.34	□□□□□ -0.75

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