RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488774.1

PTPRD-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRD, Length 420 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-212ENST00000488774 C3orf79P0CE67 100 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 GAGE10A6NGK3 116 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 SMIM13P0DJ93 91 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 VPREB1P12018 145 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 C1orf137Q5JT78 98 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 DAND5Q8N907 189 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00167Q96N53 147 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 ERG28Q9UKR5 140 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 H3BRM9 83 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP10-8P60410 259 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 LINC01545Q5VT33 79 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 C7orf33Q8WU49 177 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 TP73-AS1Q9UF72 201 aa3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM238C9JI98 176 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 LEPROTO15243 131 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 DPM2O94777 84 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV7-43P04211 117 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 CXCL5P42830 114 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 ATOH7Q8N100 152 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 LRP2P98164 4655 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa3.91□□□□□ -1.78
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PTPRD-212ENST00000488774 ANKRD39Q53RE8 183 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 LITAFQ99732 161 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 HSPB8Q9UJY1 196 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRD-212ENST00000488774 J3QQQ9 107 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 OXTP01178 125 aa3.9□□□□□ -1.79
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PTPRD-212ENST00000488774 KRTDAPP60985 99 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 LINC01600Q96MT4 127 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa3.9□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 A0A0J9YXY3 114 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 E9PLD3 99 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 M0R378 163 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 NCR3O14931 201 aa3.89□□□□□ -1.79
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PTPRD-212ENST00000488774 UBE2BP63146 152 aa3.89□□□□□ -1.79
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PTPRD-212ENST00000488774 H0Y9J4 135 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 PRLHP81277 87 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 PET117Q6UWS5 81 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 PCP2Q8IVA1 136 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 H3BS24 57 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 BCE1O60756 84 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 COX17Q14061 63 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 BOD1L2Q8IYS8 172 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRD-212ENST00000488774 C5orf52A6NGY3 159 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 ZNF861PO60384 105 aa3.86□□□□□ -1.79
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PTPRD-212ENST00000488774 LCE3BQ5TA77 95 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 ARL17AQ8IVW1 177 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 TMEM126AQ9H061 195 aa3.86□□□□□ -1.79
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PTPRD-212ENST00000488774 HERV-K104P63124 156 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 NKAPP1Q8N9T2 125 aa3.85□□□□□ -1.79
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PTPRD-212ENST00000488774 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
PTPRD-212ENST00000488774 ZNF815PA8K554 130 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 HERVK_113P61574 105 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 REG3GQ6UW15 175 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00337Q8N6G1 96 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 LINC00308Q8TCZ7 52 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 SMCR5Q8TEV8 140 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 DIRC1Q969H9 104 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 Q9BRP9 147 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRD-212ENST00000488774 IGLV6-57P01721 117 aa3.82□□□□□ -1.8
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