RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488157.5

NISCH-210, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 590 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-210ENST00000488157 SMIM13P0DJ93 91 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 COX17Q14061 63 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 LINC01545Q5VT33 79 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 LINC00167Q96N53 147 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.42□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 OXTP01178 125 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 IGLV7-43P04211 117 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 KRTDAPP60985 99 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.41□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 J3QQQ9 107 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 SMIM6P0DI80 62 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 VPREB1P12018 145 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 SFTA2Q6UW10 78 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 PET117Q6UWS5 81 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.4□□□□□ -1.22
NISCH-210ENST00000488157 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 MT1HL1P0DM35 61 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 HERVK_113P61574 105 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 HERV-K104P63124 156 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.39□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 E9PLD3 99 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 DAND5Q8N907 189 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.38□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 C12orf57Q99622 126 aa7.37□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 IGKV2D-28P01615 120 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 ATOH7Q8N100 152 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.36□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 A0A0J9YXY3 114 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 C20orf202A1L168 122 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 NMUP48645 174 aa7.34□□□□□ -1.23
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NISCH-210ENST00000488157 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 LINC01600Q96MT4 127 aa7.34□□□□□ -1.23
NISCH-210ENST00000488157 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 TMEM238C9JI98 176 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 SCGB1D1O95968 90 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.33□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 HERC1Q15751 4861 aa7.33□□□□□ -1.24
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NISCH-210ENST00000488157 H0Y9J4 135 aa7.32□□□□□ -1.24
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NISCH-210ENST00000488157 ZNF861PO60384 105 aa7.32□□□□□ -1.24
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NISCH-210ENST00000488157 REG3GQ6UW15 175 aa7.32□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 DIRC1Q969H9 104 aa7.32□□□□□ -1.24
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NISCH-210ENST00000488157 NPC2P61916 151 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.31□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 M0R378 163 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 LITAFQ99732 161 aa7.3□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 ZNF815PA8K554 130 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 TMEM126AQ9H061 195 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 TNXBP22105 4242 aa7.29□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 PRLHP81277 87 aa7.28□□□□□ -1.24
NISCH-210ENST00000488157 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.28□□□□□ -1.24
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NISCH-210ENST00000488157 UBE2AP49459 152 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 PCP2Q8IVA1 136 aa7.27□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.26□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 VAMP8Q9BV40 100 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.25□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 TSTD3H0UI37 97 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 TIMM17BO60830 172 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.24□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 NDUFC2O95298 119 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.23□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 PRYO14603 147 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 DDTP30046 118 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 SPRR1AP35321 89 aa7.22□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
NISCH-210ENST00000488157 A0A087X002 238 aa7.21□□□□□ -1.26
NISCH-210ENST00000488157 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.21□□□□□ -1.26
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