RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486812.5

PRDM15-212, Transcript of PR/SET domain 15, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM15, Length 7,072 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM15-212ENST00000486812 LINC00313P59037 77 aa7.04□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.04□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 OXTP01178 125 aa7.04□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PRDM15-212ENST00000486812 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 C16orf90A8MZG2 172 aa7□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 C1orf134Q5TEV5 83 aa7□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 TECTAO75443 2155 aa7□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 FAM229AH3BQW9 127 aa7□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 Q5VV11 94 aa7□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 PRAC1Q96KF2 57 aa6.99□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.98□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 J3QKU1 62 aa6.98□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.97□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 MED13LQ71F56 2210 aa6.97□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 Q8NA96 180 aa6.96□□□□□ -1.29
PRDM15-212ENST00000486812 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.96□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 PCNX1Q96RV3 2341 aa6.96□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.95□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV1-51P01701 117 aa6.95□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.94□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.93□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.93□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 LUZP6Q538Z0 58 aa6.93□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 IGFL1Q6UW32 110 aa6.91□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 DMAC1Q96GE9 116 aa6.91□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 PRO3102Q9H379 93 aa6.91□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 CSAG1Q6PB30 78 aa6.91□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 Q8N377 158 aa6.9□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 A0A0A0MQY5 61 aa6.9□□□□□ -1.3
PRDM15-212ENST00000486812 M0R2N4 97 aa6.9□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 A0A1B0GVX0 72 aa6.88□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.88□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 APLNQ9ULZ1 77 aa6.87□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 KLK9Q2XQG4 91 aa6.87□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 FAM104AQ969W3 186 aa6.87□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 WNK1Q9H4A3 2382 aa6.87□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 LTBP2Q14767 1821 aa6.86□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 C16orf95Q9H693 158 aa6.86□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.85□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa6.84□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 C10orf142B7Z368 130 aa6.84□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 A0A1W2PNM2 257 aa6.84□□□□□ -1.31
PRDM15-212ENST00000486812 ACACAQ13085 2346 aa6.83□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.82□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa6.82□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.82□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 PCSK5Q92824 1860 aa6.82□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 H3BNG1 76 aa6.81□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 SPINK7P58062 85 aa6.8□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 C2CD3Q4AC94 2353 aa6.8□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.8□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 CHTF8P0CG12 524 aa6.8□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 DSCR10P59022 87 aa6.78□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.78□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.78□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 CSPG4Q6UVK1 2322 aa6.78□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 C15orf56Q8N910 161 aa6.78□□□□□ -1.32
PRDM15-212ENST00000486812 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.77□□□□□ -1.33
PRDM15-212ENST00000486812 Q8NAQ8 132 aa6.76□□□□□ -1.33
PRDM15-212ENST00000486812 SPRR4Q96PI1 79 aa6.76□□□□□ -1.33
PRDM15-212ENST00000486812 Q96NJ1 140 aa6.76□□□□□ -1.33
PRDM15-212ENST00000486812 A6NN06 94 aa6.75□□□□□ -1.33
PRDM15-212ENST00000486812 FAM168BA1KXE4 195 aa6.73□□□□□ -1.33
PRDM15-212ENST00000486812 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
PRDM15-212ENST00000486812 HRES1P13985 223 aa6.71□□□□□ -1.33
PRDM15-212ENST00000486812 A0A1B0GU33 70 aa6.71□□□□□ -1.33
PRDM15-212ENST00000486812 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.7□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 NUPR2A6NF83 97 aa6.7□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 A0A096LNT2 108 aa6.69□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 PRR34Q9NV39 138 aa6.69□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 MUC4Q99102 2169 aa6.68□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 A0A0G2JQZ4 141 aa6.68□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 A0A1W2PNN7 141 aa6.68□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 A0A0D9SG42 100 aa6.66□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 ZNF575Q86XF7 245 aa6.66□□□□□ -1.34
PRDM15-212ENST00000486812 NBASA2RRP1 2371 aa6.65□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.64□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 COL4A2P08572 1712 aa6.64□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 INAFM1C9JVW0 142 aa6.64□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 LY6G6CO95867 125 aa6.64□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 GPR179Q6PRD1 2367 aa6.64□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.62□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.61□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 RTL8CO15255 209 aa6.6□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 CUL9Q8IWT3 2517 aa6.6□□□□□ -1.35
PRDM15-212ENST00000486812 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.6□□□□□ -1.35
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