RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 UBE2BP63146 152 aa11.62□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 COX17Q14061 63 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 SFTA2Q6UW10 78 aa11.61□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 DPM2O94777 84 aa11.6□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 PFN2P35080 140 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP10-8P60410 259 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 ERG28Q9UKR5 140 aa11.59□□□□□ -0.55
NISCH-209ENST00000485765 SCGB1D1O95968 90 aa11.58□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 IGKCP01834 107 aa11.58□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 LINC01545Q5VT33 79 aa11.58□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 DIRC1Q969H9 104 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 LINC00167Q96N53 147 aa11.56□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 HERVK_113P61574 105 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa11.55□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 HSBP1L1C9JCN9 74 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 PMCHL2Q9BQD1 86 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.54□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 H0Y9J4 135 aa11.53□□□□□ -0.56
NISCH-209ENST00000485765 ZNF861PO60384 105 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 VPREB1P12018 145 aa11.51□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 NKAPP1Q8N9T2 125 aa11.5□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 LINC00158P58513 81 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 HERV-K104P63124 156 aa11.49□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 GAGE10A6NGK3 116 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 LEPROTO15243 131 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 BCE1O60756 84 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 RPL24P83731 157 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 Q8NDZ9 215 aa11.48□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 NDUFA12Q9UI09 145 aa11.47□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 TSPEAR-AS2P59090 65 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 ATOH7Q8N100 152 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.46□□□□□ -0.57
NISCH-209ENST00000485765 LINC00587B1AMM8 73 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 SMIM13P0DJ93 91 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 S100A12P80511 92 aa11.45□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 A0A0U1RRA0 63 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 VAMP8Q9BV40 100 aa11.44□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa11.43□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 RPL28P46779 137 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 J3QQQ9 107 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 SMIM6P0DI80 62 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 MEIG1Q5JSS6 88 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.42□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 IGKV2D-28P01615 120 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 PYY3Q5JQD4 70 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa11.41□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 E9PLD3 99 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 NMUP48645 174 aa11.4□□□□□ -0.58
NISCH-209ENST00000485765 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-209ENST00000485765 M0R378 163 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-209ENST00000485765 ARL17AQ8IVW1 177 aa11.38□□□□□ -0.59
NISCH-209ENST00000485765 TMEM126AQ9H061 195 aa11.37□□□□□ -0.59
NISCH-209ENST00000485765 TMEM238C9JI98 176 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-209ENST00000485765 BOD1L2Q8IYS8 172 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-209ENST00000485765 PAM16Q9Y3D7 125 aa11.36□□□□□ -0.59
NISCH-209ENST00000485765 UBE2AP49459 152 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-209ENST00000485765 SPATA45Q537H7 98 aa11.35□□□□□ -0.59
NISCH-209ENST00000485765 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 ANKRD39Q53RE8 183 aa11.33□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 DAND5Q8N907 189 aa11.32□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 ZNF815PA8K554 130 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.31□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 A0A0J9YXY3 114 aa11.3□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 NCR3O14931 201 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 PRLHP81277 87 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.29□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 C12orf57Q99622 126 aa11.28□□□□□ -0.6
NISCH-209ENST00000485765 A0A087X002 238 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 PRYO14603 147 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 SPRR1AP35321 89 aa11.27□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 NDUFC2O95298 119 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 COX8AP10176 69 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 CRYGAP11844 174 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.26□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP11.25□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 LITAFQ99732 161 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.25□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 PCP2Q8IVA1 136 aa11.24□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 TSTD3H0UI37 97 aa11.23□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.3 ms