RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481114.1

SDCCAG3-210, Transcript of Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

TSL 2

Gene SDCCAG3, Length 340 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3-210ENST00000481114 COX17Q14061 63 aa7.49□□□□□ -1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.49□□□□□ -1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.49□□□□□ -1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.47□□□□□ -1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 LCE2CQ5TA81 110 aa7.47□□□□□ -1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.47□□□□□ -1.21
SDCCAG3-210ENST00000481114 XP32Q5T750 250 aa7.46□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.46□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLC3P0DOY3 106 aa7.45□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 NDUFA6P56556 154 aa7.44□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q8N377 158 aa7.44□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 PRYO14603 147 aa7.43□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 SLC25A20O43772 301 aa7.43□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 CFC1BP0CG36 223 aa7.43□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00158P58513 81 aa7.43□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 MT1HP80294 61 aa7.43□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.42□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC01546A6NGU7 62 aa7.42□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 MOBPQ13875 183 aa7.42□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.42□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 SFTA2Q6UW10 78 aa7.42□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.41□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00483Q53H64 154 aa7.41□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 FA2HQ7L5A8 372 aa7.41□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.41□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.41□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A0U1RRA0 63 aa7.4□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.4□□□□□ -1.22
SDCCAG3-210ENST00000481114 NCR3O14931 201 aa7.39□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPRR1AP35321 89 aa7.39□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.39□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 ATP6V1G1O75348 118 aa7.38□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.38□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.37□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.36□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 C11orf86A6NJI1 115 aa7.36□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 PCOTHQ58A44 107 aa7.36□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 S100A12P80511 92 aa7.35□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa7.34□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.34□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 ERC2-IT1O76042 136 aa7.34□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 SMIM13P0DJ93 91 aa7.34□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 BAGE3Q86Y29 109 aa7.34□□□□□ -1.23
SDCCAG3-210ENST00000481114 B5MCH6 92 aa7.33□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.33□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 A0A096LNJ9 63 aa7.32□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 FABP9Q0Z7S8 132 aa7.32□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.32□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 M0R2T5 61 aa7.31□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.31□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 HBDP02042 147 aa7.3□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 S100PP25815 95 aa7.3□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM223A0PJW6 202 aa7.29□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 C9orf92A6NGG3 77 aa7.29□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 PMCHL1Q16048 86 aa7.29□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 COX19Q49B96 90 aa7.29□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q9BRP9 147 aa7.29□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00614P0C842 121 aa7.28□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 Q6ZRX8 168 aa7.28□□□□□ -1.24
SDCCAG3-210ENST00000481114 DDTP30046 118 aa7.27□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa7.27□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 LINC00587B1AMM8 73 aa7.26□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 HERV-K104P63124 156 aa7.26□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 SEC11CQ9BY50 192 aa7.26□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 LIMD2Q9BT23 127 aa7.25□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.25□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.24□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.24□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 C18orf32Q8TCD1 76 aa7.24□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.23□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.22□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 IGLV6-57P01721 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.22□□□□□ -1.25
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.21□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.21□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.2□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.2□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 TMEM218A2RU14 115 aa7.2□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.2□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa7.2□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.19□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.18□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.18□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 C5orf52A6NGY3 159 aa7.17□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.17□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 UQCC3Q6UW78 93 aa7.17□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 CLLU1Q5K131 121 aa7.15□□□□□ -1.26
SDCCAG3-210ENST00000481114 COMMD7Q86VX2 200 aa7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.7 ms