RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478087.5

HPS1-211, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene HPS1, Length 971 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-211ENST00000478087 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.97□□□□□ -1.13
HPS1-211ENST00000478087 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.96□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 KRTDAPP60985 99 aa7.96□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 C1orf137Q5JT78 98 aa7.96□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.96□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 ERG28Q9UKR5 140 aa7.96□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 LRP2P98164 4655 aa7.95□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.95□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.95□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 E9PLD3 99 aa7.94□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 J3QQQ9 107 aa7.94□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 REG3GQ6UW15 175 aa7.94□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.93□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 IGLV7-43P04211 117 aa7.92□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 PFN2P35080 140 aa7.92□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.92□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 LINC00158P58513 81 aa7.91□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.91□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 C5orf52A6NGY3 159 aa7.9□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 M0QXV9 152 aa7.9□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.9□□□□□ -1.14
HPS1-211ENST00000478087 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.89□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.88□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.88□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.88□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 UBE2BP63146 152 aa7.87□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.87□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 C22orf24Q9Y442 160 aa7.87□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 LPAP08519 4548 aa7.87□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.86□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 SMIM13P0DJ93 91 aa7.86□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 H0Y9J4 135 aa7.85□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.85□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 DIRC1Q969H9 104 aa7.85□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 TIMM17BO60830 172 aa7.84□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.84□□□□□ -1.15
HPS1-211ENST00000478087 RNF213Q63HN8 5207 aa7.84□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.83□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 A0A0J9YXY3 114 aa7.83□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 ZNF815PA8K554 130 aa7.83□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 VPREB1P12018 145 aa7.83□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.83□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.83□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 A0A0U1RRA0 63 aa7.82□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.81□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 SCGB1D1O95968 90 aa7.81□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 ATOH7Q8N100 152 aa7.81□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 COPS9Q8WXC6 57 aa7.81□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.8□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 M0R378 163 aa7.8□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.8□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.8□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 LINC00167Q96N53 147 aa7.8□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 GAGE10A6NGK3 116 aa7.79□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 TMEM238C9JI98 176 aa7.79□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 NDUFC2O95298 119 aa7.79□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.79□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 Q6ZVH6 145 aa7.79□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.78□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 ZNF861PO60384 105 aa7.78□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 S100A12P80511 92 aa7.78□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.78□□□□□ -1.16
HPS1-211ENST00000478087 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.77□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.76□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 BCE1O60756 84 aa7.76□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.76□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 SPANXCQ9NY87 97 aa7.76□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 IFITM1P13164 125 aa7.75□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 DAND5Q8N907 189 aa7.75□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 LITAFQ99732 161 aa7.75□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.74□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.74□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.73□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 PRYO14603 147 aa7.73□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 IGKV2D-28P01615 120 aa7.73□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 PCP2Q8IVA1 136 aa7.73□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 Q8NDZ9 215 aa7.73□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.73□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.73□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 A0A087X002 238 aa7.72□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 NCR3O14931 201 aa7.72□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 LINC00518Q8N0U6 118 aa7.72□□□□□ -1.17
HPS1-211ENST00000478087 UBE2AP49459 152 aa7.71□□□□□ -1.18
HPS1-211ENST00000478087 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.71□□□□□ -1.18
HPS1-211ENST00000478087 VAMP8Q9BV40 100 aa7.71□□□□□ -1.18
HPS1-211ENST00000478087 TMEM126AQ9H061 195 aa7.71□□□□□ -1.18
HPS1-211ENST00000478087 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.71□□□□□ -1.18
HPS1-211ENST00000478087 DLEU1O43261 78 aa7.7□□□□□ -1.18
HPS1-211ENST00000478087 COX8AP10176 69 aa7.7□□□□□ -1.18
HPS1-211ENST00000478087 DDTP30046 118 aa7.7□□□□□ -1.18
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