RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476204.5

HOXB-AS3-208, HOXB cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4

Gene HOXB-AS3, Length 539 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HERC2O95714 4834 aa12.08□□□□□ -0.47
HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 A0A0J9YXY3 114 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ZNF815PA8K554 130 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa12.07□□□□□ -0.48
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 ARL17AQ8IVW1 177 aa12.07□□□□□ -0.48
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 INAFM2P0DMQ5 153 aa12.04□□□□□ -0.48
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 M0R378 163 aa12□□□□□ -0.49
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 RPL37AP8A6NKH3 93 aa11.94□□□□□ -0.5
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGLV7-43P04211 117 aa11.93□□□□□ -0.5
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa11.89□□□□□ -0.51
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGKV2D-28P01615 120 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-208ENST00000476204 NPC2P61916 151 aa11.88□□□□□ -0.51
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 DIRC1Q969H9 104 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-208ENST00000476204 PAM16Q9Y3D7 125 aa11.87□□□□□ -0.51
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KCNQ1DNQ9H478 68 aa11.86□□□□□ -0.51
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.85□□□□□ -0.51
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 TMEM126AQ9H061 195 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SLC25A34Q6PIV7 304 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 C14orf144Q96I85 54 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.82□□□□□ -0.52
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HOXB-AS3-208ENST00000476204 IGLV6-57P01721 117 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 UBE2AP49459 152 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HIGD1BQ9P298 99 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 H0Y9J4 135 aa11.8□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 LINC00337Q8N6G1 96 aa11.8□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 SPRR1AP35321 89 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HIST1H4GQ99525 98 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXB-AS3-208ENST00000476204 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11.77□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa11.75□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.74□□□□□ -0.53
HOXB-AS3-208ENST00000476204 TAL2Q16559 108 aa11.74□□□□□ -0.53
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