RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474346.1

TNS3-211, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TNS3, Length 775 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-211ENST00000474346 HIST1H2BBP33778 126 aa7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 HIST1H2BDP58876 126 aa7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 HIST1H2BCP62807 126 aa7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 TPRXLQ17RH7 258 aa7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 CDIP1Q9H305 208 aa7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.66□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.66□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.66□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 F8VRH5 84 aa7.66□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.66□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.66□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 ATP6V1G1O75348 118 aa7.65□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 LEPROTL1O95214 131 aa7.65□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 FABP4P15090 132 aa7.65□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.65□□□□□ -1.18
TNS3-211ENST00000474346 CXCL5P42830 114 aa7.64□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.63□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.63□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 TMEM223A0PJW6 202 aa7.62□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.62□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.61□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 LINC00167Q96N53 147 aa7.6□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 MUC17Q685J3 4493 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 UBE2AP49459 152 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.59□□□□□ -1.19
TNS3-211ENST00000474346 PFN2P35080 140 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.58□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 S100A1P23297 94 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 ERG28Q9UKR5 140 aa7.57□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 DPM2O94777 84 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.56□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 IGKCP01834 107 aa7.55□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 PLNP26678 52 aa7.55□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 A0A0U1RRA0 63 aa7.54□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.54□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.54□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 Q8NDZ9 215 aa7.54□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.54□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 GAGE10A6NGK3 116 aa7.53□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.53□□□□□ -1.2
TNS3-211ENST00000474346 LEPROTO15243 131 aa7.52□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 C3orf79P0CE67 100 aa7.52□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.52□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 A6NJY4 79 aa7.51□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 SMIM13P0DJ93 91 aa7.51□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 VPREB1P12018 145 aa7.5□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 LINC00158P58513 81 aa7.5□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 KRTDAPP60985 99 aa7.5□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 COX17Q14061 63 aa7.5□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.5□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 LINC01545Q5VT33 79 aa7.5□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 SFTA2Q6UW10 78 aa7.5□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.5□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 J3QQQ9 107 aa7.49□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 HERVK_113P61574 105 aa7.49□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.48□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 IGKV2D-28P01615 120 aa7.48□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.48□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 PET117Q6UWS5 81 aa7.48□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.48□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.48□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.47□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 HERV-K104P63124 156 aa7.47□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 PRLHP81277 87 aa7.47□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.47□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 DAND5Q8N907 189 aa7.47□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 TMEM126AQ9H061 195 aa7.47□□□□□ -1.21
TNS3-211ENST00000474346 E9PLD3 99 aa7.46□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.46□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 ATOH7Q8N100 152 aa7.45□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 NCR3O14931 201 aa7.44□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.44□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.44□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 TMEM238C9JI98 176 aa7.43□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 NMUP48645 174 aa7.43□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.43□□□□□ -1.22
TNS3-211ENST00000474346 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms