RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BDP58876 126 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BCP62807 126 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 HIST2H2BEQ16778 126 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BHQ93079 126 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BNQ99877 126 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BMQ99879 126 aa8□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 UBE2AP49459 152 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00310P59036 64 aa7.99□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 SFTA2Q6UW10 78 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 ERG28Q9UKR5 140 aa7.98□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 A0A087X002 238 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 PLNP26678 52 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.97□□□□□ -1.13
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM223A0PJW6 202 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.96□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 CRYGAP11844 174 aa7.95□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0U1RRA0 63 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 ATP6V1G1O75348 118 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 DPM2O94777 84 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 HERVK_113P61574 105 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 PRLHP81277 87 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.94□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM238C9JI98 176 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 COX17Q14061 63 aa7.93□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 IGKCP01834 107 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 VPREB1P12018 145 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00158P58513 81 aa7.92□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 PMCHL2Q9BQD1 86 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM126AQ9H061 195 aa7.91□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00587B1AMM8 73 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 Q8NDZ9 215 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.9□□□□□ -1.14
C9orf3-212ENST00000468164 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 LEPROTO15243 131 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 HERV-K104P63124 156 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.89□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 PET117Q6UWS5 81 aa7.88□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 M0R378 163 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 KRTDAPP60985 99 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.87□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 J3QQQ9 107 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 SMIM13P0DJ93 91 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.86□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 C20orf202A1L168 122 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 NMUP48645 174 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 MUC2Q02817 5179 aa7.85□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 NCR3O14931 201 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 C3orf79P0CE67 100 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 LINC01545Q5VT33 79 aa7.84□□□□□ -1.15
C9orf3-212ENST00000468164 S100A6P06703 90 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 S100A2P29034 98 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.83□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 E9PLD3 99 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.82□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 AKR1D1P51857 326 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.81□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.79□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 PRYO14603 147 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 DAND5Q8N907 189 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR4Q96PI1 79 aa7.78□□□□□ -1.16
C9orf3-212ENST00000468164 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.77□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0J9YXY3 114 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 S100A12P80511 92 aa7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 ZNF815PA8K554 130 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 CDIP1Q9H305 208 aa7.75□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 ATOH7Q8N100 152 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.74□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.73□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR1AP35321 89 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 NPC2P61916 151 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.72□□□□□ -1.17
C9orf3-212ENST00000468164 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.72□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.5 ms