RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465143.1

ITSN1-223, Transcript of intersectin 1, human

TSL 3

Gene ITSN1, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITSN1-223	ENST00000465143	HAMP	P81172	84 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	LINC01620	Q4KN68	170 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	SFTA2	Q6UW10	78 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.98	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143		A0A0U1RRA0	63 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	LINC00587	B1AMM8	73 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	TIMM17B	O60830	172 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	XG	P55808	180 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	LITAF	Q99732	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
ITSN1-223	ENST00000465143	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SMIM13	P0DJ93	91 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	PFN2	P35080	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	LINC00158	P58513	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	HSD52	Q0P140	79 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SPANXB1	Q9NS25	103 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	ERG28	Q9UKR5	140 aa		4.96	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143		F8WDY8	70 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	TAL2	Q16559	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	C21orf62-AS1	Q17RA5	79 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143		Q6ZRU5	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	DAND5	Q8N907	189 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	HSPG2	P98160	4391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.95	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SLPI	P03973	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143		Q5VSD8	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	CEND1	Q8N111	149 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	CARD19	Q96LW7	228 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143		M0R143	59 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	NPC2	P61916	151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	COX17	Q14061	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	BATF	Q16520	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143		Q6ZSA8	131 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	IFITM1	P13164	125 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	FXYD2	P54710	66 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143		Q6ZVH6	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ITSN1-223	ENST00000465143		A4D1N5	150 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143		A6NDN8	102 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	GAGE2E	Q4V326	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143		Q6ZRP5	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	FAT1	Q14517	4588 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	LOC107984156	A0A0G2JMH3	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143		K7ERJ3	54 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	CFC1	P0CG37	223 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	GAGE2B	Q13066	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	ARL17A	Q8IVW1	177 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143		A0A1B0GWB2	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ITSN1-223	ENST00000465143	PANO1	I0J062	215 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms