RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462130.1

HDLBP-230, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 4

Gene HDLBP, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-230ENST00000462130 GAGE2EQ4V326 116 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 Q6ZRP5 223 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.27□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 A0A1W2PNN7 141 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 TMEM223A0PJW6 202 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 PTTG1IPP53801 180 aa6.26□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP10-8P60410 259 aa6.25□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 DPM2O94777 84 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 TLX1NBP0CAT3 122 aa6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 IGKCP01834 107 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 C3orf79P0CE67 100 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 KRTDAPP60985 99 aa6.23□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.23□□□□□ -1.413e-10■■■■■ 32.5
HDLBP-230ENST00000462130 FAM168BA1KXE4 195 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 PFN2P35080 140 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 CXCL5P42830 114 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 PET117Q6UWS5 81 aa6.22□□□□□ -1.41
HDLBP-230ENST00000462130 S100A6P06703 90 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 PLNP26678 52 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 RNF213Q63HN8 5207 aa6.21□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 A0A0U1RRA0 63 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 LEPROTO15243 131 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.2□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 S100A2P29034 98 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 LINC01545Q5VT33 79 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.19□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00158P58513 81 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 HERVK_113P61574 105 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 C1orf137Q5JT78 98 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 ERG28Q9UKR5 140 aa6.18□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 J3QQQ9 107 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.17□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 C5orf52A6NGY3 159 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 SMIM13P0DJ93 91 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 ATOH7Q8N100 152 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 C22orf24Q9Y442 160 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 LPAP08519 4548 aa6.16□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 E9PLD3 99 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 COX17Q14061 63 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.15□□□□□ -1.42
HDLBP-230ENST00000462130 C20orf202A1L168 122 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 HERV-K104P63124 156 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 SFTA2Q6UW10 78 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 DIRC1Q969H9 104 aa6.14□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 M0QXV9 152 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 IGLV7-43P04211 117 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.13□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 GAGE10A6NGK3 116 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 SCGB1D1O95968 90 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 UBE2BP63146 152 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 DAND5Q8N907 189 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00167Q96N53 147 aa6.12□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 A0A0J9YXY3 114 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 LINC00587B1AMM8 73 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 NMUP48645 174 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 Q8NDZ9 215 aa6.11□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 H0Y9J4 135 aa6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 VPREB1P12018 145 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.09□□□□□ -1.43
HDLBP-230ENST00000462130 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 ZNF815PA8K554 130 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 AKR1D1P51857 326 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 NPC2P61916 151 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 PCP2Q8IVA1 136 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.08□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 PRR4Q16378 134 aa6.06□□□□□ -1.44
HDLBP-230ENST00000462130 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.05□□□□□ -1.44
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