RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442510.6

PTPRC-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 5,164 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-209ENST00000442510 H3BUX3 64 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 LTBP1Q14766 1721 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 LRP4O75096 1905 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 M0R2N4 97 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB136Q30KP8 78 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 NDUFAF8A1L188 74 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 CYSRT1A8MQ03 144 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 PRLHP81277 87 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.76□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 RNF223E7ERA6 249 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV1-51P01701 117 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 C9orf163Q8N9P6 203 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.74□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 COL4A1P02462 1669 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 A0A087X002 238 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 PRO0255Q9UI72 69 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 FAM229AH3BQW9 127 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 C4orf3Q8WVX3 66 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.73□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 NUPR2A6NF83 97 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 PRO3102Q9H379 93 aa3.72□□□□□ -1.81
PTPRC-209ENST00000442510 LMO4P61968 165 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 SPG11Q96JI7 2443 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 C10orf142B7Z368 130 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 CSPG4Q6UVK1 2322 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 SONP18583 2426 aaKnown RBP3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 DSCR9P59020 149 aa3.7□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1W2PNM2 257 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 DNAH10OSP0CZ25 163 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 TTC28Q96AY4 2481 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZSN1 163 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 F8W735 103 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00528Q8N1L1 170 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV6-57P01721 117 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 TNP2Q05952 138 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 GPR179Q6PRD1 2367 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZR54 194 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 CCL19Q99731 98 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 C7orf33Q8WU49 177 aa3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GUV1 79 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV7-43P04211 117 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 UTRNP46939 3433 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 HRES1P13985 223 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa3.65□□□□□ -1.82
PTPRC-209ENST00000442510 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 IGKV2-30P06310 120 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 ODF3BA8MYP8 253 aa3.65□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 SLURP1P55000 103 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 FAM208BQ5VWN6 2430 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 DSCR10P59022 87 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 CR1P17927 2039 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 COL4A5P29400 1685 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 FAM104AQ969W3 186 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 EP400Q96L91 3159 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 COL18A1P39060 1754 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 Q6ZRX8 168 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 TMEM105Q8N8V8 129 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 SPART-AS1P0CW21 52 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00483Q53H64 154 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 A0A096LNT2 108 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 Q8N377 158 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 CNBPP62633 177 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 F8P00451 2351 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 LELP1Q5T871 98 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 LINC00612Q8N6U2 182 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 APLNQ9ULZ1 77 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 RTL8CO15255 209 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 CASC10Q5T4H9 136 aa3.59□□□□□ -1.83
PTPRC-209ENST00000442510 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 LCE6AA0A183 80 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 IGFL1Q6UW32 110 aa3.58□□□□□ -1.84
PTPRC-209ENST00000442510 A0A1B0GU33 70 aa3.57□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 172.6 ms