RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 PCP2Q8IVA1 136 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 Q8IZM0 81 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 C14orf144Q96I85 54 aa7.32□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 ZNF815PA8K554 130 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 C6orf226Q5I0X4 101 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 PRO1933Q9H354 126 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.31□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 COX8AP10176 69 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 CKS1BP61024 79 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 KIAA0087Q14695 138 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 C2orf82Q6UX34 121 aa7.3□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 CXCL5P42830 114 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 PTTG1IPP53801 180 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 C10orf25Q5T742 122 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.29□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A34Q6PIV7 304 aa7.28□□□□□ -1.24
PRAME-210ENST00000442481 F8WDY8 70 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 GAGE2EQ4V326 116 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZRP5 223 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.27□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 TSTD3H0UI37 97 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 HERV-K104P63124 156 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 RNF151Q2KHN1 245 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 SFTA2Q6UW10 78 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.26□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 A0A0J9YXY3 114 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 DLEU1O43261 78 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP10-8P60410 259 aa7.25□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 A0A0U1RRA0 63 aa7.24□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PNN7 141 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 SMIM13P0DJ93 91 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 PFN2P35080 140 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 ERG28Q9UKR5 140 aa7.23□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 FAM168BA1KXE4 195 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 LINC00158P58513 81 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.22□□□□□ -1.25
PRAME-210ENST00000442481 TMEM238C9JI98 176 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.21□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 LINC00587B1AMM8 73 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 TIMM17BO60830 172 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 DAND5Q8N907 189 aa7.2□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 NPC2P61916 151 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 LITAFQ99732 161 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 HIGD1BQ9P298 99 aa7.19□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 A0A0U1RQV1 116 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 PCP4L1A6NKN8 68 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 COX17Q14061 63 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 HIST1H4GQ99525 98 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.18□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 M0QXV9 152 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 DDTP30046 118 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 UBE2BP63146 152 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 SPANXCQ9NY87 97 aa7.17□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 CTAG1AP78358 180 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 LPAP08519 4548 aa7.16□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 HSD52Q0P140 79 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 C1orf137Q5JT78 98 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.15□□□□□ -1.26
PRAME-210ENST00000442481 TAL2Q16559 108 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZVH6 145 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 DIRC1Q969H9 104 aa7.14□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 IFITM1P13164 125 aa7.13□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 CEND1Q8N111 149 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 COPS9Q8WXC6 57 aa7.12□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.11□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 A4D1N5 150 aa7.1□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 M0R143 59 aa7.1□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 FXYD2P54710 66 aa7.1□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.1□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 C22orf24Q9Y442 160 aa7.1□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.09□□□□□ -1.27
PRAME-210ENST00000442481 BATFQ16520 125 aa7.09□□□□□ -1.27
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