RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439600.2

LMO3-207, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2

Gene LMO3, Length 1,044 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-207ENST00000439600 SPATA45Q537H7 98 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 MEIG1Q5JSS6 88 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 GAGE2AQ6NT46 116 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 C6orf48Q9UBA6 75 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 LINC00158P58513 81 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 SCGB1D4Q6XE38 83 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 ERG28Q9UKR5 140 aa6.99□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 DLEU1O43261 78 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 COX8AP10176 69 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 SDIM1Q6ZPB5 146 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 CBY1Q9Y3M2 126 aa6.98□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 A0A0J9YXY3 114 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 C16orf90A8MZG2 172 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 TIMM17BO60830 172 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 PFN2P35080 140 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 COPS9Q8WXC6 57 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 DPH3Q96FX2 82 aa6.97□□□□□ -1.29
LMO3-207ENST00000439600 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 Q6ZVH6 145 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 PCP2Q8IVA1 136 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 KMT2AQ03164 3969 aa6.96□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 TMEM238C9JI98 176 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 SMIM13P0DJ93 91 aa6.95□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 Q6ZRP5 223 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 C14orf144Q96I85 54 aa6.94□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 MIEN1Q9BRT3 115 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.93□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 A0A0U1RRA0 63 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 IFITM1P13164 125 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 LINC01620Q4KN68 170 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 C12orf57Q99622 126 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 HIGD1BQ9P298 99 aa6.92□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 A0A096LNI7 61 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 UBE2V1Q13404 147 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 Q75L30 129 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 SPANXCQ9NY87 97 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.91□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 KRTAP10-1P60331 282 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.9□□□□□ -1.3
LMO3-207ENST00000439600 TSTD3H0UI37 97 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 IGKV2-30P06310 120 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 HIST1H4GQ99525 98 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 LITAFQ99732 161 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 XAGE1AQ9HD64 81 aa6.89□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 DNAH2Q9P225 4427 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 TAL2Q16559 108 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 Q6ZSA8 131 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.88□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 NDUFC2O95298 119 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 DAND5Q8N907 189 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 TP73-AS1Q9UF72 201 aa6.87□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 A0A087WYN8 130 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 CHTF8P0CG12 524 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.86□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 EPM2AB3EWF7 344 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 HERC1Q15751 4861 aa6.85□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 A0A1W2PNN7 141 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 M0R378 163 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 CDK2AP2O75956 126 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 PRO1933Q9H354 126 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 C22orf24Q9Y442 160 aa6.84□□□□□ -1.31
LMO3-207ENST00000439600 NPC2P61916 151 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-207ENST00000439600 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.83□□□□□ -1.32
LMO3-207ENST00000439600 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
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