RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428963.6

CENPN-204, Transcript of centromere protein N, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CENPN, Length 971 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPN-204ENST00000428963 YPEL4Q96NS1 127 aa4.16□□□□□ -1.74
CENPN-204ENST00000428963 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa4.15□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.15□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa4.15□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 PRLHP81277 87 aa4.15□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 TEX43Q6ZNM6 134 aa4.15□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 AMELXQ99217 191 aa4.15□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP4.15□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 NAT8BQ9UHF3 227 aa4.15□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.14□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa4.14□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 A0A1B0GXF2 115 aa4.14□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 F8VRH5 84 aa4.14□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 IGKV2D-28P01615 120 aa4.14□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.14□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.14□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa4.13□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 TMEM238C9JI98 176 aa4.13□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 S100A8P05109 93 aa4.13□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 MT1HP80294 61 aa4.13□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 C2orf66Q6UXQ4 117 aa4.13□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.13□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 PLEKHB2Q96CS7 222 aa4.13□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 C5orf52A6NGY3 159 aa4.12□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 CTAG1AP78358 180 aa4.12□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 TMEM136Q6ZRR5 245 aa4.12□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.12□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 DAND5Q8N907 189 aa4.12□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 GNB1LQ9BYB4 327 aa4.12□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 VCX2Q9H322 139 aa4.12□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 A0A1B0GW15 77 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 IGIPA6NJ69 53 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 PRSS47A8MTI9 375 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 M0R378 163 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 TRGC2P03986 189 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 Q8NDZ9 215 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 PRELID3AQ96N28 172 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 C2orf88Q9BSF0 95 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa4.11□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 S100A2P29034 98 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 ORMDL3Q8N138 153 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 TMEM126AQ9H061 195 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 CYSLTR1Q9Y271 337 aa4.1□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST1H2BKO60814 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 PPBPP02775 128 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST1H2BJP06899 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 VPREB1P12018 145 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST1H2BOP23527 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST1H2BBP33778 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 NDUFA6P56556 154 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST1H2BDP58876 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 KRTAP10-5P60370 271 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST1H2BCP62807 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HERVK_113P63121 156 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 FABP9Q0Z7S8 132 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 Q8N8P6 123 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 Q8NBF4 154 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 COX7B2Q8TF08 81 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 SPRR4Q96PI1 79 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
CENPN-204ENST00000428963 SMIM6P0DI80 62 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 CXCL5P42830 114 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 AKR1D1P51857 326 aa4.08□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 SPINK8P0C7L1 97 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 PDZD11Q5EBL8 140 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 MAP1LC3AQ9H492 121 aa4.07□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 PFN2P35080 140 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 HIST3H2BBQ8N257 126 aa4.06□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 SEC11AP67812 179 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 ORMDL2Q53FV1 153 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 Q8N377 158 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 TOMM6Q96B49 74 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 TIMM17AQ99595 171 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.05□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 S100A12P80511 92 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 BAGE3Q86Y29 109 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 C12orf57Q99622 126 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa4.04□□□□□ -1.76
CENPN-204ENST00000428963 SPINK1P00995 79 aa4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms