RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC00587B1AMM8 73 aa9.77□□□□□ -0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VPREB1P12018 145 aa9.77□□□□□ -0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FABP4P15090 132 aa9.77□□□□□ -0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLNP26678 52 aa9.77□□□□□ -0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HERV-K104P63124 156 aa9.77□□□□□ -0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COLCA2A8K830 154 aa9.76□□□□□ -0.85
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SCO1O75880 301 aa9.76□□□□□ -0.85
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 HERVK_113P61574 105 aa9.75□□□□□ -0.85
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.73□□□□□ -0.85
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 CRYGAP11844 174 aa9.7□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM238C9JI98 176 aa9.69□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 M0R378 163 aa9.69□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PRLHP81277 87 aa9.69□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PMCHL2Q9BQD1 86 aa9.69□□□□□ -0.86
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 J3QQQ9 107 aa9.67□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NMUP48645 174 aa9.67□□□□□ -0.86
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 MIEN1Q9BRT3 115 aa9.67□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NCR3O14931 201 aa9.66□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.66□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H2BKO60814 126 aa9.65□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H2BJP06899 126 aa9.65□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H2BOP23527 126 aa9.65□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H2BBP33778 126 aa9.65□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H2BDP58876 126 aa9.65□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.65□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H2BCP62807 126 aa9.65□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST2H2BEQ16778 126 aa9.65□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H2BHQ93079 126 aa9.65□□□□□ -0.86
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 HIST1H2BMQ99879 126 aa9.65□□□□□ -0.86
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A087X002 238 aa9.63□□□□□ -0.87
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa9.62□□□□□ -0.87
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.62□□□□□ -0.87
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.62□□□□□ -0.87
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DAND5Q8N907 189 aa9.61□□□□□ -0.87
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa9.6□□□□□ -0.87
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TSPAN13O95857 204 aa9.6□□□□□ -0.87
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.59□□□□□ -0.87
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 KCNQ1DNQ9H478 68 aa9.57□□□□□ -0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa9.56□□□□□ -0.88
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa9.55□□□□□ -0.88
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARL17AQ8IVW1 177 aa9.55□□□□□ -0.88
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CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRTDAPP60985 99 aa9.54□□□□□ -0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NPC2P61916 151 aa9.54□□□□□ -0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.54□□□□□ -0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.54□□□□□ -0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPRR1AP35321 89 aa9.53□□□□□ -0.88
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SPRR4Q96PI1 79 aa9.52□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF815PA8K554 130 aa9.51□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C3orf79P0CE67 100 aa9.51□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SMCR5Q8TEV8 140 aa9.51□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CBY1Q9Y3M2 126 aa9.51□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.49□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.48□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TIMM17BO60830 172 aa9.48□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRP2P98164 4655 aa9.47□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 B5MCH6 92 aa9.47□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AKR1D1P51857 326 aa9.47□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.47□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.47□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa9.47□□□□□ -0.89
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.47□□□□□ -0.89
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