RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP12.53□□□□□ -0.4
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 MDFIQ99750 246 aa12.22□□□□□ -0.45
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NUP50-AS1-201ENST00000426282 COL7A1Q02388 2944 aa12.2□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa12.18□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAB2Q8WWQ8 2551 aa12.18□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H3BQ85 93 aa12.17□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP12.17□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NKAPP1Q8N9T2 125 aa12.17□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.17□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.15□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00528Q8N1L1 170 aa12.15□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.15□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa12.15□□□□□ -0.46
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C7orf33Q8WU49 177 aa12.14□□□□□ -0.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SS18L2Q9UHA2 77 aa12.14□□□□□ -0.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DNAH9Q9NYC9 4486 aa12.14□□□□□ -0.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 B9D2Q9BPU9 175 aa12.13□□□□□ -0.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KCNQ1DNQ9H478 68 aa12.13□□□□□ -0.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa12.12□□□□□ -0.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa12.12□□□□□ -0.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q6ZQT0 140 aa12.12□□□□□ -0.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GHRHP01286 108 aa12.1□□□□□ -0.47
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APLNQ9ULZ1 77 aa12.1□□□□□ -0.47
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