RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416506.5

PCBP1-AS1-211, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PCBP1-AS1, Length 542 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.21□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TP73-AS1Q9UF72 201 aa2.21□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 A6NDN8 102 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SMIM13P0DJ93 91 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IFITM1P13164 125 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PFN2P35080 140 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CTAG1AP78358 180 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 Q6ZRU5 148 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SPANXCQ9NY87 97 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.2□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 A0A087WTM6 91 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 A0A0U1RRA0 63 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LRCOL1A6NCL2 159 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PRYO14603 147 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NPC2P61916 151 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BATFQ16520 125 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C10orf25Q5T742 122 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LINC00336Q6ZUF6 198 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CEND1Q8N111 149 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 Q8N814 137 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DAND5Q8N907 189 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PPDPFQ9H3Y8 114 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.19□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RTL8CO15255 209 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 WFDC2Q14508 124 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GAGE2EQ4V326 116 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LINC00308Q8TCZ7 52 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RAB37Q96AX2 223 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LITAFQ99732 161 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 VPS13DQ5THJ4 4388 aa2.18□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 A0A0B4J2C4 111 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NDUFC2O95298 119 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FXYD2P54710 66 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GAGE2BQ13066 116 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 Q1RN00 199 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 GAGE2AQ6NT46 116 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NKAPP1Q8N9T2 125 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LINC00474Q9P2X8 69 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LYSTQ99698 3801 aa2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 A0A096LNI7 61 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C16orf90A8MZG2 172 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 NCR3O14931 201 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 LYRM7Q5U5X0 104 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 Q6ZRP5 223 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 ARL17AQ8IVW1 177 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.16□□□□□ -2.06
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 A0A0A0MQY5 61 aa2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 A0A1B0GWB2 263 aa2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 K7ERJ3 54 aa2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 M0QXV9 152 aa2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 M0R378 163 aa2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 PSMB2P49721 201 aa2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DPH3Q96FX2 82 aa2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 TMEM126AQ9H061 195 aa2.15□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.14□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa2.14□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 H7C2G1 150 aa2.14□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 COX6CP09669 75 aa2.14□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CHTF8P0CG12 524 aa2.14□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CFC1BP0CG36 223 aa2.14□□□□□ -2.07
PCBP1-AS1-211ENST00000416506 CFC1P0CG37 223 aa2.14□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms