RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 F8WEM9 126 aa-3.94□□□□□ -3.04
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SPTSSAQ969W0 71 aa-3.94□□□□□ -3.04
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CALML5Q9NZT1 146 aa-3.97□□□□□ -3.04
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SS18L2Q9UHA2 77 aa-3.99□□□□□ -3.05
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RNU6-172P-201ENST00000411000 MNS1Q8NEH6 495 aa-4.05□□□□□ -3.06
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RNU6-172P-201ENST00000411000 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 REEP5Q00765 189 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 HSD52Q0P140 79 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 THEM6Q8WUY1 208 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 MYH3P11055 1940 aa-4.07□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 C7orf77A4D0Y5 90 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 PHLPP1O60346 1717 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 HIST1H1AQ02539 215 aaPredicted RBP-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 MLH3Q9UHC1 1453 aa-4.08□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 SHPRHQ149N8 1683 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-4.09□□□□□ -3.06
RNU6-172P-201ENST00000411000 H3BUA1 57 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAPPC2P0DI81 140 aa-4.1□□□□□ -3.07
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-4.1□□□□□ -3.07
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