RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398741.5

PRAME-201, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,202 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-201ENST00000398741 C10orf25Q5T742 122 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 KLK12Q9UKR0 248 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.9□□□□□ -0.98
PRAME-201ENST00000398741 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 Q8NDZ9 215 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.89□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 COX7CP15954 63 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 LINC00575Q6W349 94 aa8.88□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 A0A0J9YWU9 116 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.87□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 PRR34Q9NV39 138 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 hADV29S1A0JD25 119 aa8.86□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 A0A087WVE0 104 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 ENHOQ6UWT2 76 aa8.85□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 ATRQ13535 2644 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 C2orf48Q96LS8 159 aa8.84□□□□□ -0.99
PRAME-201ENST00000398741 IGLV6-57P01721 117 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.83□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 UBL5Q9BZL1 73 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 VWFP04275 2813 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 USP17L23D6RBM5 183 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 CRYGAP11844 174 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 SERP2Q8N6R1 65 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 DIRC1Q969H9 104 aa8.8□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 Q6ZQY7 126 aa8.79□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 Q6ZQT0 140 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 H3BQ85 93 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 WFDC10BQ8IUB3 73 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.78□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
PRAME-201ENST00000398741 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 DSCR8Q96T75 97 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 WIPF1O43516 503 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.77□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 COL6A5A8TX70 2615 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.76□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 COX7BP24311 80 aa8.76□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.75□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 H3BNG1 76 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 UPK3BQ9BT76 320 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 RETNQ9HD89 108 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 GHRHP01286 108 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 PDE6GP18545 87 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.74□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 Q6ZTC4 211 aa8.73□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 VPREB1P12018 145 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 Q6ZRU5 148 aa8.72□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 STAB1Q9NY15 2570 aa8.71□□□□□ -1.01
PRAME-201ENST00000398741 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 M0R2N4 97 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 M0R378 163 aa8.71□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 HAMPP81172 84 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 Q6ZVQ6 151 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 C15orf56Q8N910 161 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.7□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 TMEM258P61165 79 aa8.69□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 J3KT08 172 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 ESRGQ1W209 222 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 KRTAP10-11P60412 298 aa8.68□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.66□□□□□ -1.02
PRAME-201ENST00000398741 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.65□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.65□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 Q6ZRP5 223 aa8.65□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 CMYA5Q8N3K9 4069 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 CXCL6P80162 114 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 F8WDY8 70 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 SYCNQ0VAF6 134 aa8.64□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 BCE1O60756 84 aa8.62□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 C20orf197Q8N268 126 aa8.61□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.6□□□□□ -1.03
PRAME-201ENST00000398741 SCXQ7RTU7 201 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.9 ms