RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381565.2

APOBEC3F-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3F, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3F, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST1H2BDP58876 126 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST1H2BCP62807 126 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 UBE2BP63146 152 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST2H2BEQ16778 126 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST1H2BHQ93079 126 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC01600Q96MT4 127 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST1H2BNQ99877 126 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 HIST1H2BMQ99879 126 aa7.03□□□□□ -1.28
APOBEC3F-202ENST00000381565 H0Y8G0 127 aa7.02□□□□□ -1.29
APOBEC3F-202ENST00000381565 TP73-AS1Q9UF72 201 aa7.02□□□□□ -1.29
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APOBEC3F-202ENST00000381565 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
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APOBEC3F-202ENST00000381565 REG3GQ6UW15 175 aa7□□□□□ -1.29
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APOBEC3F-202ENST00000381565 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7□□□□□ -1.29
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APOBEC3F-202ENST00000381565 H0Y9J4 135 aa6.98□□□□□ -1.29
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APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.96□□□□□ -1.3
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APOBEC3F-202ENST00000381565 DPM2O94777 84 aa6.95□□□□□ -1.3
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APOBEC3F-202ENST00000381565 A0A0U1RRA0 63 aa6.94□□□□□ -1.3
APOBEC3F-202ENST00000381565 LEPROTO15243 131 aa6.94□□□□□ -1.3
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APOBEC3F-202ENST00000381565 LINC00158P58513 81 aa6.93□□□□□ -1.3
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APOBEC3F-202ENST00000381565 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3F-202ENST00000381565 J3QQQ9 107 aa6.91□□□□□ -1.3
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APOBEC3F-202ENST00000381565 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3F-202ENST00000381565 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.91□□□□□ -1.3
APOBEC3F-202ENST00000381565 C9orf118A6NHY6 69 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM238C9JI98 176 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3F-202ENST00000381565 TMEM126AQ9H061 195 aa6.9□□□□□ -1.3
APOBEC3F-202ENST00000381565 ATP6V1G1O75348 118 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 C3orf79P0CE67 100 aa6.89□□□□□ -1.31
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APOBEC3F-202ENST00000381565 HERVK_113P61574 105 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 DAND5Q8N907 189 aa6.89□□□□□ -1.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 E9PLD3 99 aa6.88□□□□□ -1.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 M0R378 163 aa6.88□□□□□ -1.31
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APOBEC3F-202ENST00000381565 BOD1L2Q8IYS8 172 aa6.88□□□□□ -1.31
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APOBEC3F-202ENST00000381565 PET117Q6UWS5 81 aa6.87□□□□□ -1.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa6.86□□□□□ -1.31
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APOBEC3F-202ENST00000381565 S100A1P23297 94 aa6.86□□□□□ -1.31
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APOBEC3F-202ENST00000381565 ARL17AQ8IVW1 177 aa6.86□□□□□ -1.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 A0A087X002 238 aa6.85□□□□□ -1.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa6.85□□□□□ -1.31
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APOBEC3F-202ENST00000381565 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.85□□□□□ -1.31
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APOBEC3F-202ENST00000381565 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.84□□□□□ -1.31
APOBEC3F-202ENST00000381565 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.84□□□□□ -1.31
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APOBEC3F-202ENST00000381565 SPRR1AP35321 89 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 LITAFQ99732 161 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.83□□□□□ -1.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
APOBEC3F-202ENST00000381565 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.82□□□□□ -1.32
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