RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 PLAC8Q9NZF1 115 aa14.87□□□□□ -0.03
PDSS1-201ENST00000376215 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.86□□□□□ -0.03
PDSS1-201ENST00000376215 EPM2AB3EWF7 344 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS1-201ENST00000376215 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PDSS1-201ENST00000376215 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS1-201ENST00000376215 Q8NDZ9 215 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS1-201ENST00000376215 CDK2AP2O75956 126 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS1-201ENST00000376215 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.84□□□□□ -0.03
PDSS1-201ENST00000376215 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM238C9JI98 176 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 NPC2P61916 151 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.83□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 RYR1P21817 5038 aa14.82□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 ARL17AQ8IVW1 177 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 SPANXCQ9NY87 97 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa14.81□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 LINC00308Q8TCZ7 52 aa14.79□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 C12orf57Q99622 126 aa14.79□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 HSPG2P98160 4391 aa14.79□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 VPREB1P12018 145 aa14.78□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 C2orf91Q6ZV80 131 aa14.78□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PDSS1-201ENST00000376215 MIEN1Q9BRT3 115 aa14.77□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 M0QXV9 152 aa14.76□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 C22orf24Q9Y442 160 aa14.76□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa14.75□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 Q6ZVH6 145 aa14.75□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 PRO1933Q9H354 126 aa14.74□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 HIGD1BQ9P298 99 aa14.74□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 PRR3P79522 188 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 RPL24P83731 157 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 LINC00518Q8N0U6 118 aa14.74□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.73□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 UQCR10Q9UDW1 63 aa14.73□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 IFITM1P13164 125 aa14.71□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 NKAPP1Q8N9T2 125 aa14.71□□□□□ -0.05
PDSS1-201ENST00000376215 FAT1Q14517 4588 aa14.7□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 NCR3O14931 201 aa14.69□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 C7orf33Q8WU49 177 aa14.69□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 HIST1H4GQ99525 98 aa14.69□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.69□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 NDUFC2O95298 119 aa14.68□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa14.68□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 GAGE10A6NGK3 116 aa14.67□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 LINC00167Q96N53 147 aa14.67□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 COPS9Q8WXC6 57 aa14.66□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.66□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 LINC00528Q8N1L1 170 aa14.65□□□□□ -0.06
PDSS1-201ENST00000376215 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa14.64□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 M0R378 163 aa14.64□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 IGKV2D-28P01615 120 aa14.64□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 RPL37AP8A6NKH3 93 aa14.63□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa14.62□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 UBE2BP63146 152 aa14.62□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa14.61□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 TAL2Q16559 108 aa14.61□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 A4D1N5 150 aa14.6□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa14.59□□□□□ -0.07
PDSS1-201ENST00000376215 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa14.58□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 TSTD3H0UI37 97 aa14.58□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 CEND1Q8N111 149 aa14.58□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa14.58□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 LINC00337Q8N6G1 96 aa14.57□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 HSD52Q0P140 79 aa14.56□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 Q8N1X5 172 aa14.55□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 HERC2O95714 4834 aa14.55□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 IGLV6-57P01721 117 aa14.55□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 DDTP30046 118 aa14.55□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 FXYD2P54710 66 aa14.53□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 S100A7L2Q5SY68 101 aa14.53□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 Q5VSD8 79 aa14.53□□□□□ -0.08
PDSS1-201ENST00000376215 FAM229AH3BQW9 127 aa14.52□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.52□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 KCNQ1DNQ9H478 68 aa14.51□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 CTAG1AP78358 180 aa14.5□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 C1orf137Q5JT78 98 aa14.49□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM126AQ9H061 195 aa14.49□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 A6NDN8 102 aa14.48□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 CFC1BP0CG36 223 aa14.48□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 CFC1P0CG37 223 aa14.48□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 REG3GQ6UW15 175 aa14.48□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.47□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 PRYO14603 147 aa14.47□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
PDSS1-201ENST00000376215 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa14.44□□□□□ -0.1
PDSS1-201ENST00000376215 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa14.44□□□□□ -0.1
PDSS1-201ENST00000376215 A6NJY4 79 aa14.44□□□□□ -0.1
PDSS1-201ENST00000376215 BCE1O60756 84 aa14.44□□□□□ -0.1
PDSS1-201ENST00000376215 SPRR1AP35321 89 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 73.8 ms