RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 RAB37Q96AX2 223 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 DPH3Q96FX2 82 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 C16orf90A8MZG2 172 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 A0A096LNI7 61 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 NDUFC2O95298 119 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.84□□□□□ -1.155e-6■■□□□ 11.5
PTPRK-201ENST00000368202 LINC01620Q4KN68 170 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-201ENST00000368202 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 NCR3O14931 201 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 OR13C6PQ8NH95 151 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 A0A0B4J2C4 111 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP10-2P60368 255 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.81□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 CHTF8P0CG12 524 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 CFC1BP0CG36 223 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 CFC1P0CG37 223 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 Q1RN00 199 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 DNAH2Q9P225 4427 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 M0R378 163 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 VPREB1P12018 145 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP7.78□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRK-201ENST00000368202 FAM168BA1KXE4 195 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 H7C2G1 150 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 K7ERJ3 54 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM126AQ9H061 195 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 A0A1B0GWB2 263 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 M0QXV9 152 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 IGKV2D-28P01615 120 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 C22orf24Q9Y442 160 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 PSMB2P49721 201 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 Q8NDZ9 215 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 A0A087WYN8 130 aa7.73□□□□□ -1.17
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PTPRK-201ENST00000368202 GAGE10A6NGK3 116 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 UBE2BP63146 152 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 PANO1I0J062 215 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 C7orf33Q8WU49 177 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 LINC00167Q96N53 147 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRK-201ENST00000368202 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 TSPAN13O95857 204 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 COX6CP09669 75 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP10-1P60331 282 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 C9orf118A6NHY6 69 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 H3BUT2 72 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 TAX1BP3O14907 124 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV6-57P01721 117 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 PRYO14603 147 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 VAMP3Q15836 100 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 DIRC1Q969H9 104 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 RPL28P46779 137 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.68□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 Q6ZSA8 131 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.67□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 TRIAP1O43715 76 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 C6orf99Q4VX62 202 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 REG3GQ6UW15 175 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRK-201ENST00000368202 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.66□□□□□ -1.18
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