RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 hDV103S1A0JD37 113 aa8.8□□□□□ -1
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PTPRG-201ENST00000295874 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.79□□□□□ -1
PTPRG-201ENST00000295874 Q6ZSN1 163 aa8.79□□□□□ -1
PTPRG-201ENST00000295874 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa8.79□□□□□ -1
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PTPRG-201ENST00000295874 LINC00846Q9NV44 126 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 LYPD5Q6UWN5 251 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRG-201ENST00000295874 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.51□□□□□ -1.05
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