RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.38□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 H3BMG7 143 aa7.37□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 NCR2O95944 276 aa7.37□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 CNFNQ9BYD5 112 aa7.37□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 SS18Q15532 418 aa7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 TWIST1Q15672 202 aa7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.36□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 CEND1Q8N111 149 aa7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM101Q96IK0 257 aa7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRO0461Q9UI25 63 aa7.35□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM168BA1KXE4 195 aa7.34□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 ETDBQ3ZM63 59 aa7.34□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q6ZUT4 128 aa7.34□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 CDIP1Q9H305 208 aa7.34□□□□□ -1.23
TIMMDC1-201ENST00000264244 MALP21145 153 aa7.33□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 HERV-K104P63124 156 aa7.33□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 LCE1DQ5T752 114 aa7.33□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.33□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.33□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 C2orf48Q96LS8 159 aa7.33□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.33□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A1B0GWB2 263 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 COX7A2LO14548 114 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 HBDP02042 147 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 FXYD2P54710 66 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 ORMDL3Q8N138 153 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 MUC17Q685J3 4493 aa7.32□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 NMUP48645 174 aa7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q6Q795 121 aa7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 I3L3M4 83 aa7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 CKS2P33552 79 aa7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRELID3AQ96N28 172 aa7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 C20orf78Q9BR46 151 aa7.3□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 B5MCH6 92 aa7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 M0QXV9 152 aa7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 ATP5LO75964 103 aa7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 MT-ATP8P03928 68 aa7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 PCP2Q8IVA1 136 aa7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 AMN1Q8IY45 258 aa7.29□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A096LNJ9 63 aa7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC01546A6NGU7 62 aa7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 D6R8Y8 96 aa7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 PPP1R17O96001 155 aa7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 TSHBP01222 138 aa7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM126AQ9H061 195 aa7.28□□□□□ -1.24
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPAG11BQ08648 103 aa7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 C5orf38Q86SI9 138 aa7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 MAP1LC3AQ9H492 121 aa7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A087X002 238 aa7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGKCP01834 107 aa7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 UBE2BP63146 152 aa7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 TEN1Q86WV5 123 aa7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.26□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 K7ERJ3 54 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF861PO60384 105 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 DPM2O94777 84 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 TPRXLQ17RH7 258 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 C10orf25Q5T742 122 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 FCER1GP30273 86 aa7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 GAGE2EQ4V326 116 aa7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPANXCQ9NY87 97 aa7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.24□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 TNFRSF6BO95407 300 aa7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 NPYP01303 97 aa7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 IFITM1P13164 125 aa7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 HIST1H4GQ99525 98 aa7.23□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 F8WDY8 70 aa7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMKR1H3BMG3 65 aa7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 SNCGO76070 127 aa7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 C5orf47Q569G3 176 aa7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.3 ms