RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 PAX4O43316 350 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 SS18Q15532 418 aa6.75□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 MIFP14174 115 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 KIAA0087Q14695 138 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 S100A7L2Q5SY68 101 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 FBN3Q75N90 2809 aa6.74□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 A0A087WYN8 130 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 LINC00846Q9NV44 126 aa6.73□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 LINC00158P58513 81 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 DPH3Q96FX2 82 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 USP17L23D6RBM5 183 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 UPK3BQ9BT76 320 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 CELA1Q9UNI1 258 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 COX17Q14061 63 aa6.72□□□□□ -1.33
PDCL-201ENST00000259467 XCL1P47992 114 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.71□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 LECT2O14960 151 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 DAD1P61803 113 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 NDUFC2O95298 119 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 PRR34Q9NV39 138 aa6.7□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 CCKP06307 115 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 A0A096LPF7 62 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 REG3AQ06141 175 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 LELP1Q5T871 98 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.69□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 NCR3O14931 201 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 SPART-AS1P0CW21 52 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 PFN2P35080 140 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 Q8N3U1 123 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 MUC7Q8TAX7 377 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 LINC00167Q96N53 147 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 A0A087WVE0 104 aa6.68□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.67□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 H3BNG1 76 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 LYSTQ99698 3801 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 A0A0J9YWU9 116 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.65□□□□□ -1.34
PDCL-201ENST00000259467 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.65□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 DSCR8Q96T75 97 aa6.65□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 TENM2Q9NT68 2774 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 GHRHP01286 108 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 SLPIP03973 132 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 ENHOQ6UWT2 76 aa6.64□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 BCE1O60756 84 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 Q8NDZ9 215 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 UBL5Q9BZL1 73 aa6.63□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 Q8N814 137 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 OXTP01178 125 aa6.62□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 C10orf25Q5T742 122 aa6.61□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 Q5XG85 94 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.6□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 SPAG11BQ08648 103 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 C4orf26Q17RF5 130 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 FAM236CP0DP71 79 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 HTN3P15516 51 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 C6orf223Q8N319 242 aa6.59□□□□□ -1.35
PDCL-201ENST00000259467 IGLV6-57P01721 117 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 KLK12Q9UKR0 248 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 C20orf197Q8N268 126 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.58□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 B9D2Q9BPU9 175 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 C6orf48Q9UBA6 75 aa6.57□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 EPM2AB3EWF7 344 aa6.56□□□□□ -1.36
PDCL-201ENST00000259467 H3BQ85 93 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 67.7 ms