RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625282.2

SPTAN1-210, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 2

Gene SPTAN1, Length 4,102 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-210ENST00000625282 LAMA5O15230 3695 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM104AQ969W3 186 aa6.49□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 DEFB136Q30KP8 78 aa6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZSN1 163 aa6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZTI0 123 aa6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 SCXQ7RTU7 201 aa6.48□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 ITPR3Q14573 2671 aa6.47□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 IL17DQ8TAD2 202 aa6.47□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.47□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 COX7B2Q8TF08 81 aa6.47□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 CCL18P55774 89 aa6.46□□□□□ -1.37
SPTAN1-210ENST00000625282 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa6.46□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 IGKV2D-28P01615 120 aa6.46□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 A6NDX4 124 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 LYPD5Q6UWN5 251 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 SMR3AQ99954 134 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 DAD1P61803 113 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 ITPR1Q14643 2758 aa6.45□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 CFHR3Q02985 330 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 LRBAP50851 2863 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 C11orf72Q8NBR9 251 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 MIFP14174 115 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 DEFB131AP59861 70 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.44□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 INAFM1C9JVW0 142 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 UNC79Q9P2D8 2635 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.43□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 Q8N3U1 123 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 RETNQ9HD89 108 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 A0A087WZ39 114 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 NDUFC1O43677 76 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 KLKP1Q107X0 134 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 C16orf95Q9H693 158 aa6.42□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 SLURP1P55000 103 aa6.41□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 PMAIP1Q13794 54 aa6.41□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 TM2D3Q9BRN9 247 aa6.41□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6YL49 198 aa6.41□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.4□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 LY6G6DO95868 133 aa6.4□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.4□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 H3BUA1 57 aa6.4□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
SPTAN1-210ENST00000625282 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.4□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.4□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 STHQ8IWL8 128 aa6.4□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 Q8N814 137 aa6.4□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.39□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 K7EQG2 157 aa6.39□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 NREPQ16612 68 aa6.39□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.39□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZVQ6 151 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 ATRQ13535 2644 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 CCL24O00175 119 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 K7EMT4 169 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 C6orf99Q4VX62 202 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 ITPR2Q14571 2701 aa6.38□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 ESRGQ1W209 222 aa6.37□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.37□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.36□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 RELNP78509 3460 aa6.36□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.36□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 EPM2AB3EWF7 344 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 K7EQD1 137 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 BPY2O14599 106 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 PSPHP1O15172 72 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 A8MTW9 85 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 INSP01308 110 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 KLK9Q2XQG4 91 aa6.35□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 M0R2N4 97 aa6.34□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 BCE1O60756 84 aa6.34□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF702PQ9H963 129 aa6.34□□□□□ -1.39
SPTAN1-210ENST00000625282 Q8N9L7 120 aa6.34□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 PRYO14603 147 aa6.33□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.33□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZQT0 140 aa6.33□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa6.32□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.32□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 Q6ZQY7 126 aa6.32□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
SPTAN1-210ENST00000625282 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 117.9 ms