RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592674.1

RPRD1A-211, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1A, Length 566 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1A-211ENST00000592674 Q6ZRU5 148 aa10.01□□□□□ -0.81
RPRD1A-211ENST00000592674 CKS1BP61024 79 aa10□□□□□ -0.81
RPRD1A-211ENST00000592674 C2orf82Q6UX34 121 aa10□□□□□ -0.81
RPRD1A-211ENST00000592674 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa10□□□□□ -0.81
RPRD1A-211ENST00000592674 KRTAP10-1P60331 282 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1A-211ENST00000592674 C10orf25Q5T742 122 aa9.99□□□□□ -0.81
RPRD1A-211ENST00000592674 CXCL5P42830 114 aa9.98□□□□□ -0.81
RPRD1A-211ENST00000592674 HERVK_113P61574 105 aa9.97□□□□□ -0.81
RPRD1A-211ENST00000592674 RNF151Q2KHN1 245 aa9.96□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 C6orf48Q9UBA6 75 aa9.96□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa9.95□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.95□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 AKR1D1P51857 326 aa9.94□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 ATOH7Q8N100 152 aa9.94□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 PKIGQ9Y2B9 76 aa9.94□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa9.93□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 LEPROTO15243 131 aa9.93□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.93□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 PKHD1P08F94 4074 aa9.92□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 DNAH5Q8TE73 4624 aa9.92□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 STPG4Q8N801 248 aa9.92□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 FAM30AQ9NZY2 134 aa9.92□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 E9PLD3 99 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 SCGB1D1O95968 90 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 TSPEAR-AS2P59090 65 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 SFTA2Q6UW10 78 aa9.91□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 A0A096LNI7 61 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 J3QQQ9 107 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 CHTF8P0CG12 524 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 GAGE2BQ13066 116 aa9.9□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RPRD1A-211ENST00000592674 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 Q6ZSA8 131 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.89□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.88□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 PANO1I0J062 215 aa9.88□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 PTTG1IPP53801 180 aa9.88□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.87□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 MAJINQ3KP22 176 aa9.87□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 GAGE2EQ4V326 116 aa9.87□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 Q6ZRP5 223 aa9.87□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 DPH3Q96FX2 82 aa9.87□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 LINC00474Q9P2X8 69 aa9.87□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.87□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 PFN2P35080 140 aa9.86□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 NMUP48645 174 aa9.86□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 HAMPP81172 84 aa9.86□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.86□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.86□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 ERG28Q9UKR5 140 aa9.86□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa9.85□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 CDK2AP2O75956 126 aa9.85□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 HERV-K104P63124 156 aa9.85□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP9.85□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.84□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 XGP55808 180 aa9.84□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.84□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 SCXQ7RTU7 201 aa9.84□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.84□□□□□ -0.83
RPRD1A-211ENST00000592674 COX17Q14061 63 aa9.83□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.83□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 A0A087WYN8 130 aa9.82□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 LINC00158P58513 81 aa9.82□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa9.82□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 A0A0U1RRA0 63 aa9.81□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 ZNF815PA8K554 130 aa9.81□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 SMIM13P0DJ93 91 aa9.81□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 TTTY13Q9BZ97 58 aa9.81□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 XAGE1AQ9HD64 81 aa9.81□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 LINC00587B1AMM8 73 aa9.8□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP9.8□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 A0A0J9YXY3 114 aa9.79□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.79□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 HERC2O95714 4834 aa9.78□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 FAM168BA1KXE4 195 aa9.78□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 PYY3Q5JQD4 70 aa9.78□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa9.78□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 DNAH8Q96JB1 4490 aa9.78□□□□□ -0.84
RPRD1A-211ENST00000592674 A0A1W2PNN7 141 aa9.77□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 PCP2Q8IVA1 136 aa9.77□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.77□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa9.76□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 VAMP8Q9BV40 100 aa9.76□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.75□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 APOBP04114 4563 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 SPATA45Q537H7 98 aa9.74□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 SCGB1D4Q6XE38 83 aa9.74□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 DAND5Q8N907 189 aa9.74□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 EPM2AB3EWF7 344 aa9.73□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.73□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 TIMM17BO60830 172 aa9.72□□□□□ -0.85
RPRD1A-211ENST00000592674 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 83.8 ms