RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.03□□□□□ -0.96
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PTPRS-208ENST00000590509 C6orf226Q5I0X4 101 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRS-208ENST00000590509 Q6ZN92 141 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRS-208ENST00000590509 Q8IZM0 81 aa9.02□□□□□ -0.97
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PTPRS-208ENST00000590509 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
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PTPRS-208ENST00000590509 SLC51BQ86UW2 128 aa9□□□□□ -0.97
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PTPRS-208ENST00000590509 A0A1B0GXF2 115 aa8.96□□□□□ -0.98
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PTPRS-208ENST00000590509 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
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PTPRS-208ENST00000590509 RAB5BP61020 215 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRS-208ENST00000590509 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRS-208ENST00000590509 IGIPA6NJ69 53 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-208ENST00000590509 C9JQL5 133 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-208ENST00000590509 Q8NDZ9 215 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRS-208ENST00000590509 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.93□□□□□ -0.98
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PTPRS-208ENST00000590509 M0R378 163 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-208ENST00000590509 BLOC1S1P78537 153 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-208ENST00000590509 ADIRFQ15847 76 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRS-208ENST00000590509 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.91□□□□□ -0.98
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PTPRS-208ENST00000590509 ORMDL3Q8N138 153 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1B0GW15 77 aa8.89□□□□□ -0.99
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PTPRS-208ENST00000590509 Q8NBF4 154 aa8.88□□□□□ -0.99
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PTPRS-208ENST00000590509 HERVK_113P63121 156 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRS-208ENST00000590509 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRS-208ENST00000590509 COX7B2Q8TF08 81 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRS-208ENST00000590509 SPRR4Q96PI1 79 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRS-208ENST00000590509 CXCL5P42830 114 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRS-208ENST00000590509 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.86□□□□□ -0.99
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PTPRS-208ENST00000590509 Q8N8P6 123 aa8.85□□□□□ -0.99
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PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRS-208ENST00000590509 SPINK8P0C7L1 97 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRS-208ENST00000590509 MAP1LC3AQ9H492 121 aa8.83□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 NAT8Q9UHE5 227 aa8.83□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 PFN2P35080 140 aa8.82□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.82□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
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PTPRS-208ENST00000590509 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 NPSP0C0P6 89 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 Q8N377 158 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.8□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 SEC11AP67812 179 aa8.79□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.79□□□□□ -1
PTPRS-208ENST00000590509 CFC1BP0CG36 223 aa8.78□□□□□ -1
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PTPRS-208ENST00000590509 SPINK1P00995 79 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRS-208ENST00000590509 TOMM6Q96B49 74 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRS-208ENST00000590509 TIMM17AQ99595 171 aa8.77□□□□□ -1.01
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PTPRS-208ENST00000590509 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRS-208ENST00000590509 PCOTHQ58A44 107 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRS-208ENST00000590509 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa8.75□□□□□ -1.01
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