RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM223A0PJW6 202 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 C20orf202A1L168 122 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM1B2RUZ4 78 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 COX7A2LO14548 114 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 MALP21145 153 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 HERVK_113P63121 156 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01620Q4KN68 170 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 ORAOV1Q8WV07 137 aa3.96□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087WZ39 114 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 SPAG11BQ08648 103 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf25Q5T742 122 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf82Q6UX34 121 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 RMI2Q96E14 147 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 PAM16Q9Y3D7 125 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.95□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A087WTM6 91 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 PLNP26678 52 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 NMUP48645 174 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 KIAA0087Q14695 138 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 PCP2Q8IVA1 136 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 COX7B2Q8TF08 81 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 TM2D2Q9BX73 214 aa3.94□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0U1RRA0 63 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 H3BRM9 83 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 K7EP13 123 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC11AP67812 179 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 SPATA45Q537H7 98 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZRU5 148 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 PRO1933Q9H354 126 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 RYR2Q92736 4967 aa3.93□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa3.92□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 LEPROTO15243 131 aa3.92□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 HERVK_113P61574 105 aa3.92□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 C14orf144Q96I85 54 aa3.92□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 VAMP8Q9BV40 100 aa3.92□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.92□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 E9PLD3 99 aa3.91□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 J3QQQ9 107 aa3.91□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 APOMO95445 188 aa3.91□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 PRSS2P07478 247 aa3.91□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.91□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N814 137 aa3.91□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 CAMK2N2Q96S95 79 aa3.91□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.91□□□□□ -1.78
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF815PA8K554 130 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 HSBP1L1C9JCN9 74 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 CHTF8P0CG12 524 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 PFN2P35080 140 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 NPC2P61916 151 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 SYCNQ0VAF6 134 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8IZM0 81 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01561Q8N1V8 128 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 DAND5Q8N907 189 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 CARD19Q96LW7 228 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf57Q99622 126 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA12Q9UI09 145 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 COX11Q9Y6N1 276 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.9□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 LYSTQ99698 3801 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM6P0DI80 62 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM13P0DJ93 91 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 CKS1BP61024 79 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 HAMPP81172 84 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.89□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A0J9YXY3 114 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A1B0GVY2 172 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 PANO1I0J062 215 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFA1O15239 70 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 GAGE2EQ4V326 116 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 C2orf48Q96LS8 159 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 GAGE2DQ9UEU5 116 aa3.88□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 A0A096LNI7 61 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 COX8AP10176 69 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00158P58513 81 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 KRTAP10-1P60331 282 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 S100A12P80511 92 aa3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
CAPNS1-208ENST00000589162 GAGE2BQ13066 116 aa3.87□□□□□ -1.79
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