RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567065.5

INO80E-208, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-208ENST00000567065 LINC01620Q4KN68 170 aa9.71□□□□□ -0.86
INO80E-208ENST00000567065 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.71□□□□□ -0.86
INO80E-208ENST00000567065 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
INO80E-208ENST00000567065 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
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INO80E-208ENST00000567065 CHAC1Q9BUX1 264 aa9.7□□□□□ -0.86
INO80E-208ENST00000567065 A0A087WZ39 114 aa9.69□□□□□ -0.86
INO80E-208ENST00000567065 LINC00528Q8N1L1 170 aa9.69□□□□□ -0.86
INO80E-208ENST00000567065 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.69□□□□□ -0.86
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INO80E-208ENST00000567065 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.67□□□□□ -0.86
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INO80E-208ENST00000567065 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.66□□□□□ -0.86
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INO80E-208ENST00000567065 HERVK_113P61574 105 aa9.6□□□□□ -0.87
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INO80E-208ENST00000567065 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.59□□□□□ -0.87
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INO80E-208ENST00000567065 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
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INO80E-208ENST00000567065 Q6ZRU5 148 aa9.51□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 LINC00518Q8N0U6 118 aa9.51□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.51□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 TOMM7Q9P0U1 55 aa9.51□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa9.5□□□□□ -0.89
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INO80E-208ENST00000567065 HERV-K104P63124 156 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.5□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 COX8AP10176 69 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 BOD1L2Q8IYS8 172 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 C12orf57Q99622 126 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 TNXBP22105 4242 aa9.49□□□□□ -0.89
INO80E-208ENST00000567065 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
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INO80E-208ENST00000567065 PCP2Q8IVA1 136 aa9.48□□□□□ -0.89
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