RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566833.1

CCNDBP1-209, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-209ENST00000566833 C20orf202A1L168 122 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGKCP01834 107 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 CXCL5P42830 114 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 KIAA0087Q14695 138 aa8.73□□□□□ -1.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
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CCNDBP1-209ENST00000566833 HIST1H2BLQ99880 126 aa8.72□□□□□ -1.01
CCNDBP1-209ENST00000566833 TMEM223A0PJW6 202 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 HERVK_113P61574 105 aa8.71□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 C2orf82Q6UX34 121 aa8.71□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-209ENST00000566833 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 C5orf52A6NGY3 159 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 RNF151Q2KHN1 245 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC01545Q5VT33 79 aa8.7□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 PKHD1P08F94 4074 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 C10orf25Q5T742 122 aa8.69□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-209ENST00000566833 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.69□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 AKR1D1P51857 326 aa8.68□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-209ENST00000566833 DPH3Q96FX2 82 aa8.68□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-209ENST00000566833 SFTA2Q6UW10 78 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.66□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 LEPROTO15243 131 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.65□□□□□ -1.02
CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.65□□□□□ -1.02
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CCNDBP1-209ENST00000566833 CDK2AP2O75956 126 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 CHTF8P0CG12 524 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MAJINQ3KP22 176 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 Q6ZSA8 131 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.64□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 PTTG1IPP53801 180 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 GAGE2EQ4V326 116 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 C4orf48Q5BLP8 95 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 E9PLD3 99 aa8.62□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 J3QQQ9 107 aa8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-209ENST00000566833 HAMPP81172 84 aa8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-209ENST00000566833 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.62□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-209ENST00000566833 PFN2P35080 140 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 NMUP48645 174 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 XGP55808 180 aa8.6□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 HERV-K104P63124 156 aa8.6□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-209ENST00000566833 HSBP1L1C9JCN9 74 aa8.59□□□□□ -1.03
CCNDBP1-209ENST00000566833 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.59□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-209ENST00000566833 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.59□□□□□ -1.03
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CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC00158P58513 81 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 COX17Q14061 63 aa8.58□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A0U1RRA0 63 aa8.56□□□□□ -1.04
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CCNDBP1-209ENST00000566833 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.55□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 ZNF815PA8K554 130 aa8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A1W2PNN7 141 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM168BA1KXE4 195 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 C7orf33Q8WU49 177 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.52□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 A0A0J9YXY3 114 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 FAM229AH3BQW9 127 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.51□□□□□ -1.05
CCNDBP1-209ENST00000566833 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.5□□□□□ -1.05
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