RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563857.1

RNPS1-208, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, humanhuman

TSL 2

Gene RNPS1, Length 739 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPS1-208ENST00000563857 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa10.09□□□□□ -0.79
RNPS1-208ENST00000563857 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa10.09□□□□□ -0.79
RNPS1-208ENST00000563857 FAT1Q14517 4588 aa10.08□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 F8VRH5 84 aa10.08□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 NDUFA6P56556 154 aa10.08□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 C10orf25Q5T742 122 aa10.07□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 YPEL4Q96NS1 127 aa10.07□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 C2orf82Q6UX34 121 aa10.06□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 COX7B2Q8TF08 81 aa10.06□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 PRR3P79522 188 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
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RNPS1-208ENST00000563857 GAGE2DQ9UEU5 116 aa10.05□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 A0A1W2PNN7 141 aa10.04□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 SMIM1B2RUZ4 78 aa10.04□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 IGLC3P0DOY3 106 aa10.04□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 ODF1Q14990 250 aa10.04□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 SFTA2Q6UW10 78 aa10.04□□□□□ -0.8
RNPS1-208ENST00000563857 BAGE3Q86Y29 109 aa10.04□□□□□ -0.8
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RNPS1-208ENST00000563857 CBLN2Q8IUK8 224 aa10.03□□□□□ -0.8
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RNPS1-208ENST00000563857 HSBP1O75506 76 aa10.02□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa10.02□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 REG3GQ6UW15 175 aa10.01□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa10□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 SPINK8P0C7L1 97 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 PMCHL1Q16048 86 aa9.99□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 IFI27L1Q96BM0 104 aa9.99□□□□□ -0.81
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RNPS1-208ENST00000563857 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 M0QXV9 152 aa9.97□□□□□ -0.81
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RNPS1-208ENST00000563857 TMEM170BQ5T4T1 132 aa9.97□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
RNPS1-208ENST00000563857 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa9.96□□□□□ -0.82
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
RNPS1-208ENST00000563857 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa9.96□□□□□ -0.82
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RNPS1-208ENST00000563857 HSPB8Q9UJY1 196 aa9.94□□□□□ -0.82
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RNPS1-208ENST00000563857 C11orf86A6NJI1 115 aa9.93□□□□□ -0.82
RNPS1-208ENST00000563857 COLCA2A8K830 154 aa9.93□□□□□ -0.82
RNPS1-208ENST00000563857 LEPROTL1O95214 131 aa9.93□□□□□ -0.82
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RNPS1-208ENST00000563857 C22orf24Q9Y442 160 aa9.9□□□□□ -0.82
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RNPS1-208ENST00000563857 FAM19A2Q8N3H0 131 aa9.89□□□□□ -0.83
RNPS1-208ENST00000563857 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.89□□□□□ -0.83
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RNPS1-208ENST00000563857 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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RNPS1-208ENST00000563857 PFN2P35080 140 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPS1-208ENST00000563857 HERV-K104P63124 156 aa9.87□□□□□ -0.83
RNPS1-208ENST00000563857 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.86□□□□□ -0.83
RNPS1-208ENST00000563857 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.86□□□□□ -0.83
RNPS1-208ENST00000563857 HERVK_113P61574 105 aa9.85□□□□□ -0.83
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RNPS1-208ENST00000563857 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa9.83□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 H0Y8G0 127 aa9.83□□□□□ -0.84
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RNPS1-208ENST00000563857 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP9.83□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 H0Y9J4 135 aa9.82□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 DPM2O94777 84 aa9.82□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 FABP4P15090 132 aa9.82□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 RPL28P46779 137 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 MT1HL1P0DM35 61 aa9.81□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 LINC00167Q96N53 147 aa9.81□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa9.81□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 ZNF861PO60384 105 aa9.8□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 MEIG1Q5JSS6 88 aa9.8□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 LEPROTO15243 131 aa9.79□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 BCE1O60756 84 aa9.79□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 IGKCP01834 107 aa9.79□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 NMUP48645 174 aa9.79□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 LINC00310P59036 64 aa9.79□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 NDUFA12Q9UI09 145 aa9.79□□□□□ -0.84
RNPS1-208ENST00000563857 HIST1H2BKO60814 126 aa9.78□□□□□ -0.84
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