RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 Q8N8P6 123 aa2.72□□□□□ -1.97
TMOD3-204ENST00000558666 C2orf48Q96LS8 159 aa2.72□□□□□ -1.97
TMOD3-204ENST00000558666 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.72□□□□□ -1.97
TMOD3-204ENST00000558666 C20orf78Q9BR46 151 aa2.72□□□□□ -1.97
TMOD3-204ENST00000558666 CHAC1Q9BUX1 264 aa2.72□□□□□ -1.97
TMOD3-204ENST00000558666 SMCO4Q9NRQ5 59 aa2.72□□□□□ -1.97
TMOD3-204ENST00000558666 CYSLTR1Q9Y271 337 aa2.72□□□□□ -1.97
TMOD3-204ENST00000558666 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 H0Y8G0 127 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 H7C423 109 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 PHOX2AO14813 284 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 PPBPP02775 128 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFA6P56556 154 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SYCNQ0VAF6 134 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 RHEBQ15382 184 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFA5Q16718 116 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 C2orf82Q6UX34 121 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 Q6ZN92 141 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 TEX43Q6ZNM6 134 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00173Q6ZV60 143 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 FA2HQ7L5A8 372 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00469Q8N7U9 141 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SPACA4Q8TDM5 124 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 FAM104AQ969W3 186 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM141Q96I45 108 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 FAM218AQ96MZ4 157 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SPANXA1Q9NS26 97 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.71□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 FAM168BA1KXE4 195 aa2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 C1orf196B1AJZ1 125 aa2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SCO1O75880 301 aa2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SNAPINO95295 136 aa2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SPINK8P0C7L1 97 aa2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 CNBPP62633 177 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SMAGPQ0VAQ4 97 aa2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 C2orf88Q9BSF0 95 aa2.7□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2D1P51668 147 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 RPL32P62910 135 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 ORMDL2Q53FV1 153 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 C10orf91Q5T1B1 145 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00242Q5T6M2 205 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 LCE1FQ5T754 118 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SDIM1Q6ZPB5 146 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SVBPQ8N300 66 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 C18orf32Q8TCD1 76 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 SCGB3A1Q96QR1 104 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa2.69□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 A0A096LNJ9 63 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 NDUFA1O15239 70 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 APOMO95445 188 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 TOMM6Q96B49 74 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 LITAFQ99732 161 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 GNB1LQ9BYB4 327 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 VCX2Q9H322 139 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 FAT1Q14517 4588 aa2.68□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 MYCBP2O75592 4640 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1W2PNN7 141 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 IGIPA6NJ69 53 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 MT-ND6P03923 174 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 KRTAP10-5P60370 271 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 RAB5BP61020 215 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 FAM19A2Q8N3H0 131 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 OR10D4PQ8NGN7 298 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 C7orf33Q8WU49 177 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP2.67□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 M0QXV9 152 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 HBDP02042 147 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 TRGC2P03986 189 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 CKS1BP61024 79 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2BP63146 152 aa2.66□□□□□ -1.98
TMOD3-204ENST00000558666 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42 ms