RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 TMEM258P61165 79 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-209ENST00000550857 IGKV2D-28P01615 120 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRB-209ENST00000550857 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
PTPRB-209ENST00000550857 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
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