RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547298.5

CS-208, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 656 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-208ENST00000547298 A8MWL6 223 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 PPP1R2P9O14990 202 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 PPP1R17O96001 155 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 Q6ZN92 141 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 F8VRH5 84 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 GNB1LQ9BYB4 327 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 HIGD1CA8MV81 97 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 CT83Q5H943 113 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 FAM19A2Q8N3H0 131 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 C20orf78Q9BR46 151 aa6.03□□□□□ -1.44
CS-208ENST00000547298 LCE2BO14633 110 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 TCAPO15273 167 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 CFC1P0CG37 223 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 SLC25A20O43772 301 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 BORCS7Q96B45 105 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 SMIM2Q9BVW6 85 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 TMEM141Q96I45 108 aa6□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 VPREB1P12018 145 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 FAM104BQ5XKR9 115 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 AMELXQ99217 191 aa5.99□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 SMLR1H3BR10 107 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 TEX43Q6ZNM6 134 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 Q8NDZ9 215 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 NDUFA13Q9P0J0 144 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa5.98□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 NEBP20929 6669 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 LINC00862A6NCI5 91 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 CXCL5P42830 114 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 ZNF345Q14585 488 aa5.97□□□□□ -1.45
CS-208ENST00000547298 C9orf92A6NGG3 77 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 NPYP01303 97 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 RAB5BP61020 215 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 RIGQ13278 110 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 LINC00483Q53H64 154 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 C2orf66Q6UXQ4 117 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 CKS2P33552 79 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 MOBPQ13875 183 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 SMIM1B2RUZ4 78 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 C2orf88Q9BSF0 95 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 D6R8Y8 96 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 TEX46H3BTG2 121 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 SMCR5Q8TEV8 140 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 V9GYV3 84 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 HERVK_113P63121 156 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 LINC01551Q86U37 167 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 COX7B2Q8TF08 81 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 VCX2Q9H322 139 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 OSTCQ9NRP0 149 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 IGIPA6NJ69 53 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 MT2AP02795 61 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-208ENST00000547298 HMSDA8MTL9 139 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 TMEM250H0YL14 139 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 RAB5AP20339 215 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 PDZD11Q5EBL8 140 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 GAGE2AQ6NT46 116 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 PFN2P35080 140 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 SPRR1AP35321 89 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 RAB14P61106 215 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 SEC11AP67812 179 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 FAM74A3Q4VXF1 159 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 PRSS47A8MTI9 375 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 IGLV6-57P01721 117 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 MT1FP04733 61 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 NPSP0C0P6 89 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 ERC2-IT1O76042 136 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 AKAP14Q86UN6 197 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 PPBPP02775 128 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 Q6Q795 121 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-208ENST00000547298 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-208ENST00000547298 A0A1B0GXF2 115 aa5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 109.5 ms