RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537757.5

LMO3-217, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 516 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-217ENST00000537757 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.99□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 Q6ZRU5 148 aa7.99□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 STPG4Q8N801 248 aa7.99□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.99□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 TOMM7Q9P0U1 55 aa7.99□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.98□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 NDUFA1O15239 70 aa7.98□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 SCGB1D1O95968 90 aa7.98□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 HERVK_113P61574 105 aa7.98□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 C2orf82Q6UX34 121 aa7.98□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.97□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.97□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 CKS1BP61024 79 aa7.97□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 SDIM1Q6ZPB5 146 aa7.97□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 ATOH7Q8N100 152 aa7.97□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 PLEKHB2Q96CS7 222 aa7.97□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 CARD19Q96LW7 228 aa7.97□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 C6orf48Q9UBA6 75 aa7.97□□□□□ -1.13
LMO3-217ENST00000537757 J3QQQ9 107 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 SFTA2Q6UW10 78 aa7.96□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 GCSHP23434 173 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 PYY3Q5JQD4 70 aa7.95□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 NMUP48645 174 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 MAJINQ3KP22 176 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.94□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.93□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 KRTAP10-1P60331 282 aa7.93□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 HERV-K104P63124 156 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 LINC01620Q4KN68 170 aa7.92□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa7.91□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 C16orf90A8MZG2 172 aa7.91□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 HSBP1L1C9JCN9 74 aa7.91□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.91□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 RYR1P21817 5038 aa7.91□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 COX17Q14061 63 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 Q6ZSA8 131 aa7.9□□□□□ -1.14
LMO3-217ENST00000537757 Q6ZRP5 223 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 ERG28Q9UKR5 140 aa7.89□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 LINC00587B1AMM8 73 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 PTTG1IPP53801 180 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 PCP2Q8IVA1 136 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.88□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 HSPG2P98160 4391 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 A0A096LNI7 61 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 A0A0J9YXY3 114 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 PANO1I0J062 215 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 VAMP8Q9BV40 100 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.87□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 ZNF815PA8K554 130 aa7.86□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 EPM2AB3EWF7 344 aa7.86□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.86□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 FAT1Q14517 4588 aa7.86□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 DLEU1O43261 78 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 TIMM17BO60830 172 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 SMIM13P0DJ93 91 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 PFN2P35080 140 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 GAGE2BQ13066 116 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 SPATA45Q537H7 98 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 LITAFQ99732 161 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.85□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 CHTF8P0CG12 524 aa7.84□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 SMIM6P0DI80 62 aa7.84□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 COX8AP10176 69 aa7.84□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
LMO3-217ENST00000537757 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 LINC00158P58513 81 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 GAGE2EQ4V326 116 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 MEIG1Q5JSS6 88 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 GAGE2DQ9UEU5 116 aa7.83□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 XGP55808 180 aa7.82□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.82□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 A0A0U1RRA0 63 aa7.81□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 A0A1W2PNN7 141 aa7.81□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 CDK2AP2O75956 126 aa7.81□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.81□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa7.81□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.81□□□□□ -1.16
LMO3-217ENST00000537757 C14orf144Q96I85 54 aa7.81□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.3 ms