RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532308.5

TSTA3-215, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 951 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-215ENST00000532308 VAMP8Q9BV40 100 aa13.32□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 SLPIP03973 132 aa13.31□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 NMUP48645 174 aa13.31□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 C2orf82Q6UX34 121 aa13.31□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa13.31□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 CARD19Q96LW7 228 aa13.31□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa13.3□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 TSPEAR-AS2P59090 65 aa13.3□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 Q6ZRU5 148 aa13.3□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.3□□□□□ -0.28
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TSTA3-215ENST00000532308 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.29□□□□□ -0.28
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TSTA3-215ENST00000532308 HERV-K104P63124 156 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 C10orf25Q5T742 122 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.28□□□□□ -0.28
TSTA3-215ENST00000532308 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa13.27□□□□□ -0.29
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TSTA3-215ENST00000532308 C6orf48Q9UBA6 75 aa13.26□□□□□ -0.29
TSTA3-215ENST00000532308 ZNF815PA8K554 130 aa13.24□□□□□ -0.29
TSTA3-215ENST00000532308 KRTAP10-2P60368 255 aa13.24□□□□□ -0.29
TSTA3-215ENST00000532308 A0A1B0GVY2 172 aa13.23□□□□□ -0.29
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TSTA3-215ENST00000532308 TTTY13Q9BZ97 58 aa13.22□□□□□ -0.29
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TSTA3-215ENST00000532308 ERG28Q9UKR5 140 aa13.21□□□□□ -0.29
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TSTA3-215ENST00000532308 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
TSTA3-215ENST00000532308 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa13.19□□□□□ -0.3
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TSTA3-215ENST00000532308 SCGB1D4Q6XE38 83 aa13.17□□□□□ -0.3
TSTA3-215ENST00000532308 BOD1L2Q8IYS8 172 aa13.17□□□□□ -0.3
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TSTA3-215ENST00000532308 SPANXDQ9BXN6 97 aa13.05□□□□□ -0.32
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TSTA3-215ENST00000532308 SPANXCQ9NY87 97 aa13.05□□□□□ -0.32
TSTA3-215ENST00000532308 CHTF8P0CG12 524 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-215ENST00000532308 DPH3Q96FX2 82 aa13.04□□□□□ -0.32
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TSTA3-215ENST00000532308 HIGD1BQ9P298 99 aa13.04□□□□□ -0.32
TSTA3-215ENST00000532308 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-215ENST00000532308 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.03□□□□□ -0.32
TSTA3-215ENST00000532308 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-215ENST00000532308 SPACA4Q8TDM5 124 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-215ENST00000532308 COPS9Q8WXC6 57 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-215ENST00000532308 MIEN1Q9BRT3 115 aa13.02□□□□□ -0.33
TSTA3-215ENST00000532308 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP13.01□□□□□ -0.33
TSTA3-215ENST00000532308 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13□□□□□ -0.33
TSTA3-215ENST00000532308 TSTD3H0UI37 97 aa13□□□□□ -0.33
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