RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530579.6

NEDD8-MDP1-201, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 2

Gene NEDD8-MDP1, Length 471 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RTL8CO15255 209 aa5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HERV-K104P63124 156 aa5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SYCNQ0VAF6 134 aa5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.58□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TNP2Q05952 138 aa5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C10orf25Q5T742 122 aa5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SFTA2Q6UW10 78 aa5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 BOD1L2Q8IYS8 172 aa5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q8N814 137 aa5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 UQCR10Q9UDW1 63 aa5.57□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0J9YXY3 114 aa5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A0U1RRA0 63 aa5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TSTD3H0UI37 97 aa5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DLEU1O43261 78 aa5.56□□□□□ -1.52
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PFN2P35080 140 aa5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZRU5 148 aa5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CARD19Q96LW7 228 aa5.56□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00587B1AMM8 73 aa5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SMIM13P0DJ93 91 aa5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00158P58513 81 aa5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C6orf48Q9UBA6 75 aa5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TP73-AS1Q9UF72 201 aa5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ERG28Q9UKR5 140 aa5.55□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CNBPP62633 177 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RNF151Q2KHN1 245 aa5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00336Q6ZUF6 198 aa5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LYSTQ99698 3801 aa5.53□□□□□ -1.52
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TMEM238C9JI98 176 aa5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TIMM17BO60830 172 aa5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COX17Q14061 63 aa5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C2orf91Q6ZV80 131 aa5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DAND5Q8N907 189 aa5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIST1H4GQ99525 98 aa5.52□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NPC2P61916 151 aa5.51□□□□□ -1.53
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAGE2EQ4V326 116 aa5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HIGD1BQ9P298 99 aa5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 GAGE2DQ9UEU5 116 aa5.51□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC01620Q4KN68 170 aa5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C9orf163Q8N9P6 203 aa5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LITAFQ99732 161 aa5.5□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa5.5□□□□□ -1.53
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NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DDTP30046 118 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KRTAP10-2P60368 255 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CTAG1AP78358 180 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZRP5 223 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 Q6ZVH6 145 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 MUSTN1Q8IVN3 82 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 COPS9Q8WXC6 57 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DPH3Q96FX2 82 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 XAGE1AQ9HD64 81 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SPANXCQ9NY87 97 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PKIGQ9Y2B9 76 aa5.49□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 IFITM1P13164 125 aa5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HSD52Q0P140 79 aa5.48□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 PTTG1IPP53801 180 aa5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 TAL2Q16559 108 aa5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SDIM1Q6ZPB5 146 aa5.47□□□□□ -1.53
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A096LNI7 61 aa5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C16orf90A8MZG2 172 aa5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 RPL24P83731 157 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CEND1Q8N111 149 aa5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.46□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 CHTF8P0CG12 524 aa5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 KMT2AQ03164 3969 aa5.45□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A0A1B0GVY2 172 aa5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 A4D1N5 150 aa5.44□□□□□ -1.54
NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 M0R143 59 aa5.44□□□□□ -1.54
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