RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530474.5

TSTA3-212, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 5

Gene TSTA3, Length 823 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-212ENST00000530474 PCP2Q8IVA1 136 aa8.75□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 NDUFA1O15239 70 aa8.74□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 SPAG11BQ08648 103 aa8.74□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 USP17L23D6RBM5 183 aa8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 TAL2Q16559 108 aa8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 COPS9Q8WXC6 57 aa8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 HYDINQ4G0P3 5121 aa8.73□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 HSD52Q0P140 79 aa8.72□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 LINC00336Q6ZUF6 198 aa8.72□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.72□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 ALMS1Q8TCU4 4167 aa8.72□□□□□ -1.01
TSTA3-212ENST00000530474 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.71□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 ZNF815PA8K554 130 aa8.71□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 COX17Q14061 63 aa8.71□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.71□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 CAMK2N2Q96S95 79 aa8.71□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.71□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 RNF151Q2KHN1 245 aa8.7□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 SYCNQ0VAF6 134 aa8.69□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.69□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.68□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 C15orf56Q8N910 161 aa8.68□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 A0A087WTM6 91 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 KIAA0087Q14695 138 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 Q6ZVH6 145 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM238C9JI98 176 aa8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 TIMM17BO60830 172 aa8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 Q8N814 137 aa8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 CARD19Q96LW7 228 aa8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.66□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 A6NDN8 102 aa8.65□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.65□□□□□ -1.02
TSTA3-212ENST00000530474 LECT2O14960 151 aa8.64□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 LINC00474Q9P2X8 69 aa8.64□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 A0A0J9YXY3 114 aa8.63□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 LINC00158P58513 81 aa8.63□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 BATFQ16520 125 aa8.63□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 CEND1Q8N111 149 aa8.63□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 HIST1H4GQ99525 98 aa8.63□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 ERG28Q9UKR5 140 aa8.63□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.62□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 A6NJY4 79 aa8.62□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa8.62□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.62□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa8.61□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 RTL8CO15255 209 aa8.61□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.61□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 IFITM1P13164 125 aa8.61□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 C2orf82Q6UX34 121 aa8.61□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 KMT2AQ03164 3969 aa8.61□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.6□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 Q6ZRU5 148 aa8.6□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 PFN2P35080 140 aa8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 LINC00526Q96FQ7 95 aa8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 SPANXCQ9NY87 97 aa8.59□□□□□ -1.03
TSTA3-212ENST00000530474 PTTG1IPP53801 180 aa8.58□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 TNP2Q05952 138 aa8.58□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 C6orf48Q9UBA6 75 aa8.58□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 BIRC6Q9NR09 4857 aa8.56□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 A0A1B0GWB2 263 aa8.56□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 SMIM13P0DJ93 91 aa8.56□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 FXYD2P54710 66 aa8.56□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 WFDC2Q14508 124 aa8.56□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 C10orf25Q5T742 122 aa8.56□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 LITAFQ99732 161 aa8.55□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 C16orf90A8MZG2 172 aa8.54□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.54□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 DPH3Q96FX2 82 aa8.54□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.54□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 DNAH6Q9C0G6 4158 aa8.54□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.53□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.53□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 TAX1BP3O14907 124 aa8.53□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 SLPIP03973 132 aa8.53□□□□□ -1.04
TSTA3-212ENST00000530474 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa8.52□□□□□ -1.05
TSTA3-212ENST00000530474 A0A0U1RRA0 63 aa8.52□□□□□ -1.05
TSTA3-212ENST00000530474 GAGE2BQ13066 116 aa8.52□□□□□ -1.05
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