RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLC3	P0DOY3	106 aa		10.91	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	PTTG1IP	P53801	180 aa		10.91	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	10.91	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	MAJIN	Q3KP22	176 aa		10.91	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q8IZM0	81 aa		10.91	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	DPH3	Q96FX2	82 aa		10.91	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		10.9	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSBP1	O75506	76 aa		10.9	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		10.9	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	C2orf82	Q6UX34	121 aa		10.9	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	10.9	□□□□□ -0.66
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		10.89	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	SERF1A	O75920	110 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFA6	P56556	154 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM19A2	Q8N3H0	131 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	STPG4	Q8N801	248 aa		10.88	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	OXT	P01178	125 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRSS2	P07478	247 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE2B	Q13066	116 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		10.87	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	NUPR1	O60356	82 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	IFI27L1	Q96BM0	104 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		10.86	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV12-1	A0A0B4J245	112 aa		10.85	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131		H3BRM9	83 aa		10.85	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	CKS1B	P61024	79 aa		10.85	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q6ZRP5	223 aa		10.85	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	C11orf86	A6NJI1	115 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPINK8	P0C7L1	97 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	CXCL5	P42830	114 aa		10.84	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BK	O60814	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BJ	P06899	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BO	P23527	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BB	P33778	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BD	P58876	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BC	P62807	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST2H2BE	Q16778	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST2H2BF	Q5QNW6	126 aa	Predicted RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	COX7B2	Q8TF08	81 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BH	Q93079	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BN	Q99877	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	HIST1H2BM	Q99879	126 aa		10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	CHTOP	Q9Y3Y2	248 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A1W2PNN7	141 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131		F8VRH5	84 aa		10.82	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	10.82	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	LEPROTL1	O95214	131 aa		10.81	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	S100A1	P23297	94 aa		10.8	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	ODF1	Q14990	250 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE2E	Q4V326	116 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	C7orf33	Q8WU49	177 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SH3BP2-223	ENST00000512131	ATP6V1G1	O75348	118 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSPB8	Q9UJY1	196 aa		10.77	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		10.76	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM223	A0PJW6	202 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM168B	A1KXE4	195 aa		10.75	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	HNRNPA3	P51991	378 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	10.75	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNF213	Q63HN8	5207 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	FABP4	P15090	132 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	LRP2	P98164	4655 aa		10.74	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	10.72	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131		H0Y8G0	127 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	SFTA2	Q6UW10	78 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		10.71	□□□□□ -0.69
SH3BP2-223	ENST00000512131	TNXB	P22105	4242 aa		10.71	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	PLN	P26678	52 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	MAP1LC3C	Q9BXW4	147 aa		10.69	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	MT1HL1	P0DM35	61 aa		10.68	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	DPM2	O94777	84 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	COX17	Q14061	63 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	ERG28	Q9UKR5	140 aa		10.67	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0QXV9	152 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		10.66	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	PFN2	P35080	140 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	PMCHL2	Q9BQD1	86 aa		10.65	□□□□□ -0.7
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKC	P01834	107 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	C22orf24	Q9Y442	160 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	TP73-AS1	Q9UF72	201 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	LINC01545	Q5VT33	79 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	PET117	Q6UWS5	81 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	LEPROT	O15243	131 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SH3BP2-223	ENST00000512131	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		10.61	□□□□□ -0.71

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