RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510074.5

SH3BP2-215, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 649 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-215ENST00000510074 Q8IZM0 81 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP2-215ENST00000510074 VCX2Q9H322 139 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP2-215ENST00000510074 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP2-215ENST00000510074 CTAG1AP78358 180 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP2-215ENST00000510074 ALKAL2Q6UX46 152 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP2-215ENST00000510074 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.15□□□□□ -0.94
SH3BP2-215ENST00000510074 F8VRH5 84 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 LINC00337Q8N6G1 96 aa9.14□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 MUC17Q685J3 4493 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 SRP19P09132 144 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 ORMDL3Q8N138 153 aa9.13□□□□□ -0.95
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SH3BP2-215ENST00000510074 NKAPP1Q8N9T2 125 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 PRELID3AQ96N28 172 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 SEC11AP67812 179 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa9.1□□□□□ -0.95
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SH3BP2-215ENST00000510074 HERVK_113P63121 156 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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SH3BP2-215ENST00000510074 AMELXQ99217 191 aa9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SH3BP2-215ENST00000510074 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa9.08□□□□□ -0.96
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SH3BP2-215ENST00000510074 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 MAP1LC3AQ9H492 121 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 NAT8Q9UHE5 227 aa9.07□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa9.06□□□□□ -0.96
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SH3BP2-215ENST00000510074 IGKV2D-28P01615 120 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.06□□□□□ -0.96
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SH3BP2-215ENST00000510074 NPSP0C0P6 89 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 PRLHP81277 87 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 ORMDL2Q53FV1 153 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa9.04□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 IGIPA6NJ69 53 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.03□□□□□ -0.96
SH3BP2-215ENST00000510074 Q8N8P6 123 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP2-215ENST00000510074 PLEKHB2Q96CS7 222 aa9.02□□□□□ -0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 SCO1O75880 301 aa9.01□□□□□ -0.97
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SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM126AQ9H061 195 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.99□□□□□ -0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 K7EMI3 77 aa8.99□□□□□ -0.97
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SH3BP2-215ENST00000510074 TMEM238C9JI98 176 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.98□□□□□ -0.97
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SH3BP2-215ENST00000510074 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.97□□□□□ -0.97
SH3BP2-215ENST00000510074 ATP5LO75964 103 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 PFN2P35080 140 aa8.96□□□□□ -0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 TIMM17AQ99595 171 aa8.96□□□□□ -0.98
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SH3BP2-215ENST00000510074 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
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SH3BP2-215ENST00000510074 SPINK8P0C7L1 97 aa8.93□□□□□ -0.98
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SH3BP2-215ENST00000510074 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.92□□□□□ -0.98
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SH3BP2-215ENST00000510074 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.9□□□□□ -0.98
SH3BP2-215ENST00000510074 H3BRM9 83 aa8.89□□□□□ -0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 ADCYAP1P18509 176 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 CST9LQ9H4G1 147 aa8.88□□□□□ -0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 COX17Q14061 63 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 ERG28Q9UKR5 140 aa8.86□□□□□ -0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 LINC01549A6NIU2 74 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 PMVKQ15126 192 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP2-215ENST00000510074 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.84□□□□□ -0.99
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